Probe-level estimation improves the detection of differential splicing in Affymetrix exon array studies.
Probe-level estimation improves the detection of differential splicing in Affymetrix exon array studies.
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DOI：
10.1186/gb-2009-10-7-r77
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发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Elo LL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Laajala E;Aittokallio T;Lahesmaa R;Elo LL
提出了一种利用Affymetrix外显子阵列探针级信息检测差异剪接的统计方法。最近外显子微阵列的出现使得揭示全球范围内可选剪接事件的差异成为可能。我们介绍了一种新的统计程序，在检测样品组之间的差异剪接时，充分利用Affymetrix外显子阵列的探针级信息。与现有的排序方法相比，该方法在区分真实的生物学发现和背景噪声方面显示出优越的再现性和准确性，与实验验证高度一致。
A novel statistical procedure is presented that uses probe-level information on Affymetrix exon arrays to detect differential splicing. The recent advent of exon microarrays has made it possible to reveal differences in alternative splicing events on a global scale. We introduce a novel statistical procedure that takes full advantage of the probe-level information on Affymetrix exon arrays when detecting differential splicing between sample groups. In comparison to existing ranking methods, the procedure shows superior reproducibility and accuracy in distinguishing true biological findings from background noise in high agreement with experimental validations.
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影响因子：
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作者：
Shai, O;Morris, QD;Frey, BJ
通讯作者：
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