The MEME Suite.
The MEME Suite.
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DOI：
10.1093/nar/gkv416
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发表时间：
2015-07-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Noble WS
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bailey TL;Johnson J;Grant CE;Noble WS
MEME Suite是一套功能强大的基于网络的集成工具，用于研究蛋白质、DNA和RNA中的序列基序。这些基序编码许多生物学功能，并且它们的检测和表征在细胞中分子相互作用的研究中是重要的，包括基因表达的调节。自2009年Nucleic Acids Research Web Server Issue中对MEME套件的描述以来，我们增加了六个新工具。在这里，我们描述了套件中所有工具的功能，给出了最佳使用建议，并提供了几个案例研究，以说明如何将各种MEME套件工具的结果联合收割机用于成功的基于图案的分析。MEME套件可在http://meme-suite.org上免费供学术使用，源代码也可供下载和本地安装。
The MEME Suite is a powerful, integrated set of web-based tools for studying sequence motifs in proteins, DNA and RNA. Such motifs encode many biological functions, and their detection and characterization is important in the study of molecular interactions in the cell, including the regulation of gene expression. Since the previous description of the MEME Suite in the 2009 Nucleic Acids Research Web Server Issue, we have added six new tools. Here we describe the capabilities of all the tools within the suite, give advice on their best use and provide several case studies to illustrate how to combine the results of various MEME Suite tools for successful motif-based analyses. The MEME Suite is freely available for academic use at http://meme-suite.org, and source code is also available for download and local installation.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btr064
发表时间：
2011-04-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Grant CE;Bailey TL;Noble WS
通讯作者：
Noble WS
影响因子：
14.8
作者：
通讯作者：
--
发现具有任意插入和删除的序列基序。
影响因子：
4.3
作者：
Frith, Martin C.;Saunders, Neil F. W.;Kobe, Bostjan;Bailey, Timothy L.
通讯作者：
Bailey, Timothy L.
DOI：
10.1073/pnas.2133080100
发表时间：
2003-10-14
影响因子：
11.1
作者：
Lopez-Estraño, C;Bhattacharjee, S;Haldar, K
通讯作者：
Haldar, K
模因套件：用于发现和搜索的工具。
影响因子：
14.9
作者：
Bailey TL;Boden M;Buske FA;Frith M;Grant CE;Clementi L;Ren J;Li WW;Noble WS
通讯作者：
Noble WS