独行菜种子bHLH类转录因子基因家族及 幼苗 laICE 1表达对冷胁迫的响应
独行菜种子bHLH类转录因子基因家族及 幼苗 laICE 1表达对冷胁迫的响应
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DOI：
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发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
赵惠新
中科院分区：
文献类型：
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作者：
袁琳琳;王亚茹;曾卫军;谢红桃;杜 钰;卢 函;赵惠新
该研究在转录组数据基础上，以独行菜（ Ｌｅｐｉｄｉｕｍ ａｐｅｔａｌｕｍ Ｗｉｌｌｄ． ）种子耐受和不能耐受低温萌发的 ２ 组.样本为材料，对其 ｂＨＬＨ 转录因子家族成员进行分析，并对该家族成员表达差异极显著的 ｌａＩＣＥ １ 基因进行克隆、.序列分析、结构预测，以探讨独行菜幼苗中 ｌａＩＣＥ １ 基因表达对低温胁迫的响应特征。结果表明：（ １ ）萌发中的独行.菜种子，至少有 ８３ 个 ｂＨＬＨ 转录因子序列表达，相对于低温萌发停滞组，在低温萌发耐受组的独行菜种子中，有.１０个下调、 １３个上调、.６０个表达差异不显著。其中表达量极显著下调的序列ｃ２０００９ ＿ ｇ１具有１ ５０３ｂｐ 开放阅读.框， ＧＯ注释到 ＩＣＥ １基因，该基因命名为 ｌａＩＣＥ.１ 。（ ２ ） ｌａＩＣＥ １基因编码５００ａａ ，蛋白分子量为５４ ６３５．１９ｋＤ ，理论.等电点为５．４５ ，分子式为 Ｃ ２３６４ Ｈ ３７４２ Ｎ ６８８ Ｏ ７５８ Ｓ ２２ ；该蛋白具有保守结构域ｂＨＬＨ 。（.３ ）定量分析表明， ｌａＩＣＥ １基因在.非低温胁迫的独行菜种子中的表达量显著低于一直处于低温胁迫中不能进行萌发的独行菜种子，这与转录组数据.库中该序列表达情况一致；而 ｌａＩＣＥ １基因在独行菜幼苗期经低温处理后，其表达量显著上调，表明 ｌａＩＣＥ １基因可.能在独行菜幼苗耐受低温生长中具有一定的作用。