Chemical shift assignments for F-plasmid TraI (381-569).
Chemical shift assignments for F-plasmid TraI (381-569).
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DOI：
10.1007/s12104-010-9269-y
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发表时间：
2011-04
影响因子：
0.9
通讯作者：
Schildbach JF
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wright NT;Majumdar A;Schildbach JF
TraI，F质粒编码的切口酶，是一种1，756个氨基酸的蛋白质，对于F质粒DNA从一种细菌接合转移到另一种细菌是必需的。虽然F TraI的N-和C-末端结构域的晶体结构已经确定，但蛋白质的中心结构域在结构上尚未探索。已知这些中间结构域（在残基306和1，500之间）通过高度进行性解旋酶活性结合单链DNA（ssDNA）和解旋DNA。在这个中心区域中，更多的C-末端部分（~900-1500）似乎与E. coliRecBCD复合物。然而，更多的N-末端部分（306-900）显示出与其他蛋白质有限的序列相似性。在试图定义这个中间区域的折叠结构域的结构和辨别其功能，我们已经分离出的TraI的稳定区域有限的蛋白水解。这些区域之一，TraI（381-569），被确定和编码它的基因构建体被工程化。表达、纯化蛋白质，并对其序列特异性化学位移进行分配。
TraI, the F plasmid-encoded nickase, is a 1,756 amino acid protein essential for conjugative transfer of F plasmid DNA from one bacterium to another. While crystal structures of N- and C-terminal domains of F TraI have been determined, central domains of the protein are structurally unexplored. These middle domains (between residues 306 and 1,500) are known to both bind single-stranded DNA (ssDNA) and unwind DNA through a highly processive helicase activity. Of this central region, the more C-terminal portion (~900–1500) appears related to helicase RecD of the E. coli RecBCD complex. The more N-terminal portion (306–900), however, shows limited sequence similarity to other proteins. In an attempt to define the structure of well-folded domains of this middle region and discern their function, we have isolated stable regions of TraI following limited proteolysis. One of these regions, TraI (381–569), was identified and a genetic construct encoding it was engineered. The protein was expressed, purified, and the sequence-specific chemical shifts for it were assigned.
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影响因子：
5.6
作者：
LLOSA, M;GRANDOSO, G;DELACRUZ, F
通讯作者：
DELACRUZ, F
影响因子：
5.6
作者：
Guogas, Laura M.;Kennedy, Sarah A.;Lee, Jin-Hyup;Redinbo, Matthew R.
通讯作者：
Redinbo, Matthew R.
DOI：
10.1073/pnas.90.7.2925
发表时间：
1993-04-01
影响因子：
11.1
作者：
PANSEGRAU, W;SCHRODER, W;LANKA, E
通讯作者：
LANKA, E
影响因子：
3.2
作者：
Dostal, Lubomir;Schildbach, Joel F.
通讯作者：
Schildbach, Joel F.
影响因子：
5.6
作者：
Llosa, M;Grandoso, G;delaCruz, F
通讯作者：
delaCruz, F