pysimm: A python package for simulation of molecular systems
pysimm: A python package for simulation of molecular systems
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DOI：
10.1016/j.softx.2016.12.002
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发表时间：
2017-01-01
期刊：
影响因子：
3.4
通讯作者：
Colina, Coray M.
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Fortunato, Michael E.;Colina, Coray M.
在这项工作中，我们提出了pysimm，一个python包，旨在促进分子系统的结构生成，模拟和修改。Pysimm提供了一系列仿真工具，并与高度优化的第三方软件顺利集成。抽象层使标准化的方法能够将各种力场模型分配给分子系统并执行简单的模拟。这些特点使pysimm能够帮助快速发展的新应用，特别是在非晶聚合物模拟领域。(C) 2016年作者。Elsevier B.V.出版
In this work, we present pysimm, a python package designed to facilitate structure generation, simulation, and modification of molecular systems. pysimm provides a collection of simulation tools and smooth integration with highly optimized third party software. Abstraction layers enable a standardized methodology to assign various force field models to molecular systems and perform simple simulations. These features have allowed pysimm to aid the rapid development of new applications specifically in the area of amorphous polymer simulations. (C) 2016 The Authors. Published by Elsevier B.V.