AutoDock4 and AutoDockTools4: Automated docking with selective receptor flexibility.
AutoDock4 and AutoDockTools4: Automated docking with selective receptor flexibility.
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DOI：
10.1002/jcc.21256
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发表时间：
2009-12
影响因子：
3
通讯作者：
Olson, Arthur J.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Morris, Garrett M.;Huey, Ruth;Lindstrom, William;Sanner, Michel F.;Belew, Richard K.;Goodsell, David S.;Olson, Arthur J.
我们描述了AutoDock 4的测试和发布以及附带的图形用户界面AutoDockTools。AutoDock 4在受体中结合了有限的灵活性。这里报道了几个测试，包括与188个不同的配体-蛋白质复合物的重新对接实验和在87个HIV蛋白酶复合物中使用柔性侧链的交叉对接实验。我们还报告了它的效用在共价结合配体的分析，使用基于网格的对接方法和修改的灵活侧链技术。
We describe the testing and release of AutoDock4 and the accompanying graphical user interface AutoDockTools. AutoDock4 incorporates limited flexibility in the receptor. Several tests are reported here, including a redocking experiment with 188 diverse ligand-protein complexes and a cross-docking experiment using flexible sidechains in 87 HIV protease complexes. We also report its utility in analysis of covalently-bound ligands, using both a grid-based docking method and a modification of the flexible sidechain technique.
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DOI：
10.1002/prot.10028
发表时间：
2002-01-01
期刊：
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND GENETICS
影响因子：
--
作者：
Österberg, F;Morris, GM;Goodsell, DS
通讯作者：
Goodsell, DS
影响因子：
2.1
作者：
GASTEIGER, J;MARSILI, M
通讯作者：
MARSILI, M
影响因子：
3
作者：
Morris, GM;Goodsell, DS;Olson, AJ
通讯作者：
Olson, AJ
影响因子：
5.7
作者：
Sanner, MF
通讯作者：
Sanner, MF
影响因子：
5.8
作者：
Zhao, Yong;Stoffler, Daniel;Sanner, Michel
通讯作者：
Sanner, Michel