The Vertebrate Genome Annotation (Vega) database.
The Vertebrate Genome Annotation (Vega) database.
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DOI：
10.1093/nar/gki135
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发表时间：
2005-01-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Hubbard T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ashurst JL;Chen CK;Gilbert JG;Jekosch K;Keenan S;Meidl P;Searle SM;Stalker J;Storey R;Trevanion S;Wilming L;Hubbard T
脊椎动物基因组注释 (Vega) 数据库 (http://vega.sanger.ac.uk) 旨在成为一个社区资源，用于浏览各种脊椎动物基因组的成品序列的手动注释。其核心数据库基于 Ensembl 风格的模式，并经过扩展以合并特定于管理的元数据。 Vega 与基因组测序中心合作，试图对已发表的人类染色体序列提供一致的高质量注释。此外，还可以查看其他脊椎动物（包括小鼠和斑马鱼）的各种完成区域。 Vega 仅显示使用转录证据构建的手动注释基因结构，可以在浏览器中检查。已经尝试标准化每个脊椎动物基因组的注释程序，这应该有助于对不同完成区域的直系同源物进行比较分析。
The Vertebrate Genome Annotation (Vega) database (http://vega.sanger.ac.uk) has been designed to be a community resource for browsing manual annotation of finished sequences from a variety of vertebrate genomes. Its core database is based on an Ensembl-style schema, extended to incorporate curation-specific metadata. In collaboration with the genome sequencing centres, Vega attempts to present consistent high-quality annotation of the published human chromosome sequences. In addition, it is also possible to view various finished regions from other vertebrates, including mouse and zebrafish. Vega displays only manually annotated gene structures built using transcriptional evidence, which can be examined in the browser. Attempts have been made to standardize the annotation procedure across each vertebrate genome, which should aid comparative analysis of orthologues across the different finished regions.
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影响因子：
14.9
作者：
Wheeler DL;Church DM;Edgar R;Federhen S;Helmberg W;Madden TL;Pontius JU;Schuler GD;Schriml LM;Sequeira E;Suzek TO;Tatusova TA;Wagner L
通讯作者：
Wagner L
影响因子：
7
作者：
Mallon, AM;Wilming, L;Brown, SDM
通讯作者：
Brown, SDM
影响因子：
14.9
作者：
Finn RD;Mistry J;Tate J;Coggill P;Heger A;Pollington JE;Gavin OL;Gunasekaran P;Ceric G;Forslund K;Holm L;Sonnhammer EL;Eddy SR;Bateman A
通讯作者：
Bateman A
影响因子：
64.8
作者：
Deloukas, P;Matthews, LH;Rogers, J
通讯作者：
Rogers, J
影响因子：
7.7
作者：
Hill, NJ;Lyons, PA;Peterson, LB
通讯作者：
Peterson, LB