Revealing histone variant induced changes via quantitative proteomics.
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DOI：
10.3109/10409238.2011.577052
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发表时间：
2011-08
影响因子：
6.5
通讯作者：
Garcia BA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Arnaudo AM;Molden RC;Garcia BA
组蛋白变体是连接蛋白和核心组蛋白的异构体，它们的氨基酸序列不同。这些变异具有不同的基因组位置和翻译后修饰，从而增加了染色质结构的复杂性。组蛋白变异的生物学研究表明，它们在许多过程中发挥作用，包括转录、DNA损伤反应和细胞周期。组蛋白变体之间存在的氨基酸序列的微小差异和不同的翻译后修饰状态使得使用免疫分析方法进行传统分析具有挑战性。近年来，许多质谱技术已经发展到在全蛋白或肽水平上鉴定和定量组蛋白。在这篇综述中，我们讨论了组蛋白变异的生物学和方法来表征他们使用质谱为基础的蛋白质组学。
Histone variants are isoforms of linker and core histone proteins that differ in their amino acid sequences. These variants have distinct genomic locations and post-translational modifications, thus increasing the complexity of the chromatin architecture. Biological studies of histone variants indicate that they play a role in many processes including transcription, DNA damage response, and the cell cycle. The small differences in amino acid sequence and the diverse post-translational modification states that exist between histone variants make traditional analysis using immunoassay methods challenging. In recent years, a number of mass spectrometric techniques have been developed to identify and quantify histones at the whole protein or peptide levels. In this review we discuss the biology of histone variants and methods to characterize them using mass spectrometry-based proteomics.
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