Characterization of the Zebrafish Cell Landscape at Single-Cell Resolution.
Characterization of the Zebrafish Cell Landscape at Single-Cell Resolution.
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单细胞分辨率下斑马鱼细胞景观的表征
DOI：
10.3389/fcell.2021.743421
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发表时间：
2021
影响因子：
5.5
通讯作者：
Guo G
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Jiang M;Xiao Y;E W;Ma L;Wang J;Chen H;Gao C;Liao Y;Guo Q;Peng J;Han X;Guo G
斑马鱼已被发现是生物学和再生研究的首要模式生物。然而，全面的细胞组成和分子动力学在斑马鱼组织再生过程中仍然知之甚少。在这里，我们利用Microwell-seq分析了超过250，000个涵盖主要斑马鱼细胞类型的单细胞，并构建了系统的斑马鱼细胞景观。我们揭示了18种斑马鱼组织类型的单细胞组成，包括胚胎和成体阶段。尾鳍再生的单细胞定位揭示了斑马鱼组织修复中芽基群体的独特特征和关键的遗传调控。总的来说，我们的单细胞数据集证明了斑马鱼细胞景观资源在生物学研究的各个领域的实用性。
Zebrafish have been found to be a premier model organism in biological and regeneration research. However, the comprehensive cell compositions and molecular dynamics during tissue regeneration in zebrafish remain poorly understood. Here, we utilized Microwell-seq to analyze more than 250,000 single cells covering major zebrafish cell types and constructed a systematic zebrafish cell landscape. We revealed single-cell compositions for 18 zebrafish tissue types covering both embryo and adult stages. Single-cell mapping of caudal fin regeneration revealed a unique characteristic of blastema population and key genetic regulation involved in zebrafish tissue repair. Overall, our single-cell datasets demonstrate the utility of zebrafish cell landscape resources in various fields of biological research.
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