Importing MAGE-ML format microarray data into BioConductor
Importing MAGE-ML format microarray data into BioConductor
复制标题
DOI：
10.1093/bioinformatics/bth396
复制
发表时间：
2004-12-12
期刊：
影响因子：
5.8
通讯作者：
De Moor, B
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Durinck, S;Allemeersch, J;De Moor, B
微阵列基因表达标记语言（MAGE-ML）是一种广泛使用的XML（可扩展标记语言）标准，用于描述和交换有关微阵列实验的信息。它可以描述微阵列设计、微阵列实验设计、基因表达数据和数据分析结果。我们描述了RMAGEML，一个新的Bioconductor包，提供了一个链接的cDNA微阵列数据存储在MAGE-ML格式和Bioconductor框架的预处理，可视化和分析的微阵列实验。
The microarray gene expression markup language (MAGE-ML) is a widely used XML (eXtensible Markup Language) standard for describing and exchanging information about microarray experiments. It can describe microarray designs, microarray experiment designs, gene expression data and data analysis results. We describe RMAGEML, a new Bioconductor package that provides a link between cDNA microarray data stored in MAGE-ML format and the Bioconductor framework for preprocessing, visualization and analysis of microarray experiments.