Quantitative analysis of protein-protein interactions and post-translational modifications in rare immune populations.
Quantitative analysis of protein-protein interactions and post-translational modifications in rare immune populations.
复制标题
DOI：
10.1038/s41467-017-01808-6
复制
发表时间：
2017-11-15
影响因子：
16.6
通讯作者：
Abramson J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Avin A;Levy M;Porat Z;Abramson J
尽管蛋白质组学最近取得了进展，但对稀有细胞群中蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 或翻译后修饰 (PTM) 的定量分析仍然具有挑战性。对于直接从人类或动物模型中分离出来的稀有免疫和/或干细胞群的分析尤其如此，并且这些细胞群通常具有多种表面标记物。为了克服这些限制，我们开发了邻近连接成像细胞术（PLIC），这是一种用于稀有细胞蛋白质组分析的方案。具体来说，通过在胸腺髓质上皮细胞（mTEC）（作为稀有免疫群体的范例）上使用 PLIC，我们证明 PLIC 克服了传统蛋白质组学方法的固有局限性，并能够在单细胞水平上对 PPI 和 PTM 进行高分辨率检测和定量。尽管蛋白质组学取得了进步，但罕见的免疫细胞或干细胞群仍难以定量分析蛋白质-蛋白质相互作用或翻译后修饰。在这里，作者开发了邻近连接成像细胞术，用于单细胞水平的高分辨率检测。
In spite of recent advances in proteomics, quantitative analyses of protein–protein interactions (PPIs) or post-translational modifications (PTMs) in rare cell populations remain challenging. This is in particular true for analyses of rare immune and/or stem cell populations that are directly isolated from humans or animal models, and which are often characterized by multiple surface markers. To overcome these limitations, here we have developed proximity ligation imaging cytometry (PLIC), a protocol for proteomic analysis of rare cells. Specifically, by employing PLIC on medullary thymic epithelial cells (mTECs), which serve as a paradigm for a rare immune population, we demonstrate that PLIC overcomes the inherent limitations of conventional proteomic approaches and enables a high-resolution detection and quantification of PPIs and PTMs at a single cell level. Rare immune or stem cell populations are difficult to quantitatively analyze for protein-protein interactions or post-translational modifications despite advances in proteomics. Here the authors develop proximity ligation imaging cytometry for high-resolution detection at a single cell level.
登录
查看更多内容
影响因子：
29.7
作者：
Davis BK;Wen H;Ting JP
通讯作者：
Ting JP
影响因子：
4.6
作者：
Löf L;Arngården L;Olsson-Strömberg U;Siart B;Jansson M;Dahlin JS;Thörn I;Christiansson L;Hermansson M;Larsson A;Ahlstrand E;Wålinder G;Söderberg O;Rosenquist R;Landegren U;Kamali-Moghaddam M
通讯作者：
Kamali-Moghaddam M
影响因子：
30.5
作者：
Aschenbrenner, Katharina;D'Cruz, Louise M.;Klein, Ludger
通讯作者：
Klein, Ludger
影响因子：
46.9
作者：
Fredriksson, S;Gullberg, M;Landegren, U
通讯作者：
Landegren, U
影响因子：
56.9
作者：
Anderson, MS;Venanzi, ES;Mathis, D
通讯作者：
Mathis, D