Circular genome visualization and exploration using CGView
Circular genome visualization and exploration using CGView
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DOI：
10.1093/bioinformatics/bti054
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发表时间：
2005-02-15
期刊：
影响因子：
5.8
通讯作者：
Wishart, DS
中科院分区：
文献类型：
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作者：
Stothard, P;Wishart, DS
CGView（Circular Genome Viewer）是一个Java应用程序和库，用于生成高质量的圆形基因组的可缩放图。它将XML或制表符分隔的输入转换为图形地图（PNG、JPG或可缩放矢量图形格式），并包含序列特征、标签、图例和脚注。除了默认的全视图地图外，程序还可以生成一系列显示扩展视图的超链接地图。可以使用任何网络浏览器探索链接的图谱，从而允许快速基因组浏览并促进数据共享。
: CGView (Circular Genome Viewer) is a Java application and library for generating high-quality, zoomable maps of circular genomes. It converts XML or tab-delimited input into a graphical map (PNG, JPG or Scalable Vector Graphics format), complete with sequence features, labels, legends and footnotes. In addition to the default full view map, the program can generate a series of hyperlinked maps showing expanded views. The linked maps can be explored using any Web browser, allowing rapid genome browsing and facilitating data sharing.