Structural basis for phosphopantetheinyl carrier domain interactions in the terminal module of nonribosomal peptide synthetases.
Structural basis for phosphopantetheinyl carrier domain interactions in the terminal module of nonribosomal peptide synthetases.
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DOI：
10.1016/j.chembiol.2011.09.018
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发表时间：
2011-11-23
影响因子：
--
通讯作者：
Bruner SD
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Liu Y;Zheng T;Bruner SD
磷酸泛酰巯基乙胺修饰的载体结构域在几类初级和次级代谢产物的模板导向的生物合成中起核心作用。脂肪酸、聚酮化合物和非核糖体肽构建在多结构域酶组装体上，使用磷酸泛酰巯基乙胺基硫酯连接的载体结构域来运输和激活结构单元。载体结构域是该过程的动态组成部分，将途径中间体穿梭到连续的酶活性位点。在这里，我们报告了一种方法，以结构固定载体结构域/酶的构建适合于X射线晶体学分析。E.用缀合的基于磷酸泛酰巯基乙胺的抑制剂测定大肠杆菌EntF。双结构域结构被锁定在与非核糖体肽生物合成的化学相关的活性方向上。该结构提供了磷酸泛酰巯基乙胺臂与载体结构域和硫酯酶结构域的活性位点的相互作用的细节。
Phosphopantetheine-modified carrier domains play a central role in the template-directed, biosynthesis of several classes of primary and secondary metabolites. Fatty acids, polyketides and nonribosomal peptides are constructed on multidomain enzyme assemblies using phosphopantetheinyl thioester-linked carrier domains to traffic and activate building blocks. The carrier domain is a dynamic component of the process, shuttling pathway intermediates to sequential enzyme active sites. Here we report an approach to structurally fix carrier domain/enzyme constructs suitable for X-ray crystallographic analysis. The structure of a two-domain construct of E. coli EntF was determined with a conjugated phosphopantetheinyl-based inhibitor. The didomain structure is locked in an active orientation relevant to the chemistry of nonribosomal peptide biosynthesis. This structure provides details into the interaction of phosphopantetheine arm with the carrier domain and the active site of the thioesterase domain.
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DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
影响因子：
5.7
作者：
Bruner, SD;Weber, T;Stubbs, MT
通讯作者：
Stubbs, MT
影响因子：
2.9
作者：
Findlow, SC;Winsor, C;Crump, MP
通讯作者：
Crump, MP
影响因子：
2.9
作者：
Li, Q;Khosla, C;Liu, CW
通讯作者：
Liu, CW
影响因子：
3.2
作者：
Liu, Ye;Bruner, Steven D.
通讯作者：
Bruner, Steven D.