Human AlkB homologue 1 (ABH1) exhibits DNA lyase activity at abasic sites.
Human AlkB homologue 1 (ABH1) exhibits DNA lyase activity at abasic sites.
复制标题
DOI：
10.1016/j.dnarep.2009.10.011
复制
发表时间：
2010-01-02
期刊：
影响因子：
3.8
通讯作者：
Hausinger RP
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Müller TA;Meek K;Hausinger RP
细菌AlkB和三种人类AlkB同系物（ABH 1、ABH 2和ABH 3）是Fe 2 +/2-酮戊二酸依赖性加氧酶，可直接修复烷基化损伤的DNA。在这里，我们发现ABH 1出乎意料地具有第二活性，在脱碱基（AP）位点切割DNA，例如那些自发产生的烷基化依赖的脱嘌呤反应。ABH 1的DNA切割活性不需要添加Fe 2+或2-酮戊二酸，不受EDTA抑制，并且不受推定的金属结合残基突变的影响，这表明该活性产生于与用于去甲基化的活性位点不同的活性位点。AP-特异性DNA切割显示通过裂解酶机制发生，而不是通过水解，酶保持与DNA产物相关。ABH 1可以在相对DNA链上的紧密间隔的AP位点处切割，从而在体外产生双链断裂，并且该反应可能与该意想不到的AP裂解酶活性的生理作用有关。
Bacterial AlkB and three human AlkB homologues (ABH1, ABH2, and ABH3) are Fe2+/2-oxoglutarate-dependent oxygenases that directly repair alkylation-damaged DNA. Here, we show that ABH1 unexpectedly has a second activity, cleaving DNA at abasic (AP) sites such as those arising spontaneously from alkylation-dependent depurination reactions. The DNA cleavage activity of ABH1 does not require added Fe2+ or 2-oxoglutarate, is not inhibited by EDTA, and is unaffected by mutation of the putative metal-binding residues, indicating that this activity arises from an active site distinct from that used for demethylation. AP-specific DNA cleavage was shown to occur by a lyase mechanism, rather than by hydrolysis, with the enzyme remaining associated with the DNA product. ABH1 can cleave at closely spaced AP sites on opposite DNA strands yielding double-strand breaks in vitro and this reaction may relate to the physiological role of this unexpected AP lyase activity.
登录
查看更多内容
影响因子：
2.5
作者：
Pan, Zishu;Sikandar, Shaheen;Lipkin, Steven M.
通讯作者：
Lipkin, Steven M.
影响因子：
16
作者：
Ougland, R;Zhang, CM;Falnes, PO
通讯作者：
Falnes, PO
影响因子：
4.8
作者：
Fitzgerald, Megan E.;Drohat, Alexander C.
通讯作者：
Drohat, Alexander C.
DOI：
10.1016/j.bbapap.2008.08.001
发表时间：
2008-11-01
影响因子：
3.2
作者：
Ilina, Ekaterina S.;Lavrik, Olga I.;Khodyreva, Svetlana N.
通讯作者：
Khodyreva, Svetlana N.
通过小鼠和人 FTO 对单链 DNA 和 RNA 中的 3-甲基胸腺嘧啶和 3-甲基尿嘧啶进行氧化去甲基化。
影响因子：
3.5
作者：
Jia, Guifang;Yang, Cai-Guang;Yang, Shangdong;Jian, Xing;Yi, Chengqi;Zhou, Zhiqiang;He, Chuan
通讯作者：
He, Chuan