云南中甸地区3个牛种PRNP基因23 bp和12 bp位点的InDel多态性与表达水平
云南中甸地区3个牛种PRNP基因23 bp和12 bp位点的InDel多态性与表达水平
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DOI：
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
席冬梅
中科院分区：
文献类型：
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作者：
和晓明;Sameeullah Memon;刘兴能;岳丹;邓卫东;席冬梅
为了探讨云南中甸地区3个地方牛种（中甸牦牛、中甸犏牛、中甸黄牛）朊蛋白基因（PRNP）启动子区和第1内含子区2个位点（23 bp和12 bp）的插入/缺失（indel）突变与PRNP基因 mRNA 表达的相关性，采用聚合酶链式反应、琼脂糖电泳及测序等方法对3个牛种的PRNP基因23 bp和12 bp位点进行基因分型，比较各组间2个位点的等位基因及基因型分布是否存在差异，并进一步采用荧光定量PCR检测延髓组织内PRNP基因表达水平，分析基因型与基因表达水平的关系。结果表明：中甸牦牛的23 bp indel缺失纯合（-/-）基因型频率最高（0.838），插入等位基因频率极低（0.09），中甸犏牛（0.467）和中甸黄牛（0.399）的缺失纯合基因型频率也较高；而在12 bp indel中，3种牛的插入纯合（+/+）基因型频率很高，缺失等位基因频率较低；中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23-12+为主，频率为0.794和0.444，而中甸黄牛主单倍型为23+12-，频率为0.434。性别、年龄和毛色对3种牛延髓组织中PRNP基因的mRNA表达量无显著影响（P>0.05）；3种牛23 bp和12 bp的不同基因型和单倍型之间的mRNA表达量差异均不显著（P>0.05），可能与不同基因型mRNA表达量测定时获得的样品量差异太大有关。研究揭示，23 bp indel缺失等位基因频率和基因型频率在3种牛中都是最高的，而在12 bp indel中，缺失等位基因频率和基因型频率均较低，对比以往认为的BSE抗病单倍型23+12+，中甸牦牛和中甸犏牛单倍型均以23-12+为主，中甸黄牛以23+12-为主，可通过育种改良筛选，培育对BSE有较高抗病性的群体。