Real-time selective sequencing using nanopore technology.
Real-time selective sequencing using nanopore technology.
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DOI：
10.1038/nmeth.3930
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发表时间：
2016-09
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Stout, Michael
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Loose, Matthew;Malla, Sunir;Stout, Michael
牛津纳米孔小人通过实时感知分子穿过纳米孔时电流的变化来对DNA进行测序。可选的是，特定纳米孔两端的电压可以颠倒，喷射出DNA分子。这使得选择特定的DNA分子进行测序成为可能。我们使用动态时间扭曲来匹配阅读与参考，选择小基因组的区域，单个扩增子，或扩增子集的归一化。这种直接实时选择特定DNA分子的首次演示使许多新的未来应用成为可能。
The Oxford Nanopore MinION sequences DNA by sensing changes in electrical current flow in real-time as molecules traverse nanopores. Optionally, the voltage across specific nanopores can be reversed, ejecting the DNA molecule. This enables “Read Until”, the selection of specific DNA molecules for sequencing. We use dynamic time warping to match reads to reference, selecting regions of small genomes, individual amplicons, or normalization of the amplicon set. This first demonstration of direct selection of specific DNA molecules in real-time enables many novel future applications.
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影响因子：
7
作者：
Goodwin S;Gurtowski J;Ethe-Sayers S;Deshpande P;Schatz MC;McCombie WR
通讯作者：
McCombie WR
影响因子：
3.4
作者：
Timp, Winston;Comer, Jeffrey;Aksimentiev, Aleksei
通讯作者：
Aksimentiev, Aleksei
影响因子：
46.9
作者：
Ashton, Philip M.;Nair, Satheesh;O'Grady, Justin
通讯作者：
O'Grady, Justin
影响因子：
12.3
作者：
Quick J;Ashton P;Calus S;Chatt C;Gossain S;Hawker J;Nair S;Neal K;Nye K;Peters T;De Pinna E;Robinson E;Struthers K;Webber M;Catto A;Dallman TJ;Hawkey P;Loman NJ
通讯作者：
Loman NJ
影响因子：
2
作者：
Skutkova, Helena;Vitek, Martin;Provaznik, Ivo
通讯作者：
Provaznik, Ivo