A general screening strategy for peptide-based fluorogenic ligands: probes for dynamic studies of PDZ domain-mediated interactions.
A general screening strategy for peptide-based fluorogenic ligands: probes for dynamic studies of PDZ domain-mediated interactions.
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DOI：
10.1021/ja900371q
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发表时间：
2009-05-20
影响因子：
15
通讯作者：
Imperiali B
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Sainlos M;Iskenderian WS;Imperiali B
提出了一种基于环境敏感发色团的I类PDZ结构域高效探针的系统和通用方法。首先将衍生自Stargazin的C末端序列的一系列肽与PSD-95和Shank 3的PDZ结构域一起使用，以鉴定4-DMAP发色团的最佳位置和接头长度。将结果应用于每组结构域的充分表征的配体序列，以产生保留其天然序列特异性并在结合时产生显著荧光增加的高亲和力探针。这些探针构成了研究PDZ结构域介导的相互作用的动力学和调控机制的有效工具。
A systematic and general approach for identifying efficient probes for class I PDZ domains based on environment-sensitive chromophores is presented. A series of peptides derived from the C-terminal sequence of Stargazin was first used with PDZ domains of PSD-95 and Shank3 to identify the optimal position and linker length for the 4-DMAP chromophore. The results were applied to well-characterized ligand sequences for each set of domains to generate high affinity probes that retain their native sequence specificity and yield remarkable fluorescence increases upon binding. These probes constitute efficient tools to study the dynamics and regulatory mechanisms of PDZ domain-mediated interactions.
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