Quartz-Seq: a highly reproducible and sensitive single-cell RNA sequencing method, reveals non-genetic gene-expression heterogeneity.
Quartz-Seq: a highly reproducible and sensitive single-cell RNA sequencing method, reveals non-genetic gene-expression heterogeneity.
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DOI：
10.1186/gb-2013-14-4-r31
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发表时间：
2013-04-17
期刊：
影响因子：
12.3
通讯作者：
Ueda HR
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Sasagawa Y;Nikaido I;Hayashi T;Danno H;Uno KD;Imai T;Ueda HR
开发一种高度可重复且灵敏的单细胞RNA测序（RNA - seq）方法将有助于理解非遗传性细胞异质性的生物学作用及其潜在机制。在这项研究中，我们报道了一种新型的单细胞RNA测序方法，称为Quartz - Seq，它与现有方法相比，实验流程更简单，可重复性和灵敏度更高。我们表明，单细胞Quartz - Seq能够定量检测各种非遗传性细胞异质性，并且能够检测不同的细胞类型以及单一细胞类型的不同细胞周期阶段。此外，这种方法能够全面揭示同一细胞周期阶段中同一细胞类型的单细胞之间的基因表达异质性。
Development of a highly reproducible and sensitive single-cell RNA sequencing (RNA-seq) method would facilitate the understanding of the biological roles and underlying mechanisms of non-genetic cellular heterogeneity. In this study, we report a novel single-cell RNA-seq method called Quartz-Seq that has a simpler protocol and higher reproducibility and sensitivity than existing methods. We show that single-cell Quartz-Seq can quantitatively detect various kinds of non-genetic cellular heterogeneity, and can detect different cell types and different cell-cycle phases of a single cell type. Moreover, this method can comprehensively reveal gene-expression heterogeneity between single cells of the same cell type in the same cell-cycle phase.
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影响因子：
2.5
作者：
Hayashi, Tetsutaro;Shibata, Norito;Agata, Kiyokazu
通讯作者：
Agata, Kiyokazu
影响因子：
46.9
作者：
通讯作者：
--
DOI：
10.1073/pnas.1003975107
发表时间：
2010-07-27
影响因子：
11.1
作者：
Kittisopikul, Mark;Suel, Gurol M.
通讯作者：
Suel, Gurol M.
影响因子：
64.8
作者：
Chang, Hannah H.;Hemberg, Martin;Huang, Sui
通讯作者：
Huang, Sui
影响因子：
30.8
作者：
Dunlop, Mary J.;Cox, Robert Sidney, III;Levine, Joseph H.;Murray, Richard M.;Elowitz, Michael B.
通讯作者：
Elowitz, Michael B.