Genome Annotation and Curation Using MAKER and MAKER-P.
Genome Annotation and Curation Using MAKER and MAKER-P.
复制标题
DOI：
10.1002/0471250953.bi0411s48
复制
发表时间：
2014-12-12
影响因子：
--
通讯作者：
Yandell, Mark
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Campbell, Michael S;Holt, Carson;Moore, Barry;Yandell, Mark
本单元描述了如何使用基因组注释和管理工具MAKER和MAKER-P来注释新组装的基因组中的蛋白质编码和非编码RNA基因，根据新的证据更新/联合收割机传统注释，为来自其他管道的注释添加质量指标，并将现有注释映射到新的组件。MAKER和MAKER-P可以快速注释任何大小的基因组，并扩展到匹配可用的计算资源。
This unit describes how to use the genome annotation and curation tools MAKER and MAKER-P to annotate protein coding and non-coding RNA genes in newly assembled genomes, update/combine legacy annotations in light of new evidence, add quality metrics to annotations from other pipelines, and map existing annotations to a new assembly. MAKER and MAKER-P can rapidly annotate genomes of any size, and scale to match available computational resources.