Single-Cell Multi-omics: An Engine for New Quantitative Models of Gene Regulation.
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DOI：
10.1016/j.tig.2018.06.001
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发表时间：
2018-09
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Trapnell C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Packer J;Trapnell C
多细胞生物体中的细胞通过制定细胞类型特异性的基因调控程序来实现特定的功能。单细胞RNA测序技术提供了细胞类型特异性基因表达的变革性观点，细胞类型特异性基因调控程序的输出。这篇综述将讨论新的单细胞基因组技术，通过提供转录组之外的细胞状态的额外读数来补充单细胞RNA-seq。我们将强调回归模型是一种简单而强大的方法，可以将基因表达与细胞状态的其他方面联系起来;在此过程中，我们将深入了解产生给定基因表达输出所必需的生化机制。
Cells in a multicellular organism fulfill specific functions by enacting cell type specific programs of gene regulation. Single cell RNA sequencing technologies have provided a transformative view of cell type specific gene expression, the output of cell type specific gene regulatory programs. This review will discuss new single cell genomic technologies that complement single cell RNA-seq by providing additional readouts of cellular state beyond the transcriptome. We will highlight regression models as a simple yet powerful approach to relate gene expression to other aspects of cellular state; and in doing so, gain insights into the biochemical mechanisms that are necessary to produce a given gene expression output.
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