Complete genome sequence of the heavy metal resistant bacterium Agromyces aureus AR33(T) and comparison with related Actinobacteria.
Complete genome sequence of the heavy metal resistant bacterium Agromyces aureus AR33(T) and comparison with related Actinobacteria.
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DOI：
10.1186/s40793-016-0217-z
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发表时间：
2017
影响因子：
--
通讯作者：
Brader G
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Corretto E;Antonielli L;Sessitsch A;Compant S;Höfer C;Puschenreiter M;Brader G
Agromyces aureus AR 33 T是一种革兰氏阳性、杆状和能动细菌，属于放线菌门中的微杆菌科，分离自奥地利的前锌/铅开采和加工场所。在本研究中，对全基因组进行测序，并将从Illumina MiSeq和桑格测序获得的序列组合。该序列全长4,373,124 bp，GC含量为70.1%。此外，我们与其他相关生物进行了比较基因组分析：6种土壤霉菌属，4微杆菌科以及放线菌纲的另外两个成员。本文的在线版本（doi：10.1186/s40793-016-0217-z）包含补充材料，可供授权用户使用。
Agromyces aureus AR33T is a Gram-positive, rod-shaped and motile bacterium belonging to the Microbacteriaceae family in the phylum Actinobacteria that was isolated from a former zinc/lead mining and processing site in Austria. In this study, the whole genome was sequenced and assembled combining sequences obtained from Illumina MiSeq and Sanger sequencing. The assembly resulted in the complete genome sequence which is 4,373,124 bp long and has a GC content of 70.1%. Furthermore, we performed a comparative genomic analysis with other related organisms: 6 Agromyces spp., 4 Microbacteriaceae spp. and 2 other members of the class Actinobacteria. The online version of this article (doi:10.1186/s40793-016-0217-z) contains supplementary material, which is available to authorized users.
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