Use of historic metabolic biotransformation data as a means of anticipating metabolic sites using MetaPrint2D and Bioclipse.
Use of historic metabolic biotransformation data as a means of anticipating metabolic sites using MetaPrint2D and Bioclipse.
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DOI：
10.1186/1471-2105-11-362
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发表时间：
2010-07-01
影响因子：
3
通讯作者：
Boyer S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Carlsson L;Spjuth O;Adams S;Glen RC;Boyer S
预测代谢位点在药物发现过程中非常重要，有助于快速优化化合物。没有交互式工具存在，大多数有用的工具是相当昂贵的。在这里，提出了一种快速可靠的方法来分析配体和可视化潜在的代谢位点，这是基于注释的代谢数据，由圆形指纹描述。该方法可通过图形工作台Bioclipse获得，该工作台配备了化学信息学中的高级功能。由于预测的速度（每个分子不到50毫秒），科学家在编辑化学结构时可以获得真实的时间决策支持。Bioclipse是一个富客户端，这意味着所有计算都在本地计算机上执行，不需要网络连接。Bioclipse和MetaPrint2D对所有用户免费，在开源许可证下发布，可从http://www.bioclipse.net获得。
Predicting metabolic sites is important in the drug discovery process to aid in rapid compound optimisation. No interactive tool exists and most of the useful tools are quite expensive. Here a fast and reliable method to analyse ligands and visualise potential metabolic sites is presented which is based on annotated metabolic data, described by circular fingerprints. The method is available via the graphical workbench Bioclipse, which is equipped with advanced features in cheminformatics. Due to the speed of predictions (less than 50 ms per molecule), scientists can get real time decision support when editing chemical structures. Bioclipse is a rich client, which means that all calculations are performed on the local computer and do not require network connection. Bioclipse and MetaPrint2D are free for all users, released under open source licenses, and available from http://www.bioclipse.net.
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DOI：
10.1021/ci025584y
发表时间：
2003-03
期刊：
Journal of chemical information and computer sciences
影响因子：
--
作者：
Steinbeck C;Han Y;Kuhn S;Horlacher O;Luttmann E;Willighagen E
通讯作者：
Willighagen E
影响因子：
7.3
作者：
Cruciani, G;Carosati, E;Vianello, R
通讯作者：
Vianello, R
影响因子：
3
作者：
Spjuth O;Helmus T;Willighagen EL;Kuhn S;Eklund M;Wagener J;Murray-Rust P;Steinbeck C;Wikberg JE
通讯作者：
Wikberg JE
影响因子：
3.5
作者：
Boyer, S;Zamora, I
通讯作者：
Zamora, I
影响因子：
5.6
作者：
Boyer, Scott;Arnby, Catrin Hasselgren;Glen, Robert C.
通讯作者：
Glen, Robert C.