慢性肾脏病大鼠基于RNA-seq的肠道转录组学分析
慢性肾脏病大鼠基于RNA-seq的肠道转录组学分析
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DOI：
10.3969/j.issn.1006-298x.2021.01.002
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发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
陈蕾
中科院分区：
文献类型：
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作者：
渠宁;蒋红利;李洁;魏丽敏;高凡凡;陈蕾
目的:分析慢性肾脏病(CKD)大鼠与假手术组大鼠肠道基因表达谱的差异,探讨基因表达差异与CKD肠道变化及并发症的关系。方法:Sprague-Dawley大鼠随机分为CKD组与假手术组,CKD组行5/6肾切除术构建CKD模型。28周后收取大鼠血清及空肠组织标本;Masson及天狼猩红染色观察空肠病理变化;每组随机选择3个空肠标本进行RNA-seq检测。结果:CKD组大鼠空肠胶原组成较假手术组差异显著;共筛选出420个差异表达基因(DEGs),CKD大鼠肠道基因表达谱差异显著。GO(gene ontology)及KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析发现DEGs主要富集到消化系统通路和细胞外基质构建。通过STRING及Cytoscape筛选出Hub基因。结论:CKD大鼠基因表达差异显著,主要影响消化酶的分泌和细胞外基质的正常结构及功能,可能与CKD患者的胃肠道症状及肠屏障破坏有较大关联。