DNAzyme-mediated catalysis with only guanosine and cytidine nucleotides.
DNAzyme-mediated catalysis with only guanosine and cytidine nucleotides.
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DOI：
10.1093/nar/gkn930
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发表时间：
2009-02
影响因子：
14.9
通讯作者：
Li, Yingfu
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Schlosser, Kenny;Li, Yingfu
单链DNA分子具有采用被称为DNA酶的催化活性结构的能力，尽管这种能力的基本限制尚未确定。从由所有四种类型的标准核苷酸组成的亲本DNA酶开始，我们对周围的序列空间进行了搜索，以鉴定具有仅由三种类型的核苷酸组成的催化核心的功能衍生物，并且随后仅由两种类型的核苷酸组成。我们提供了第一份报告的DNAzyme，只包含鸟苷和胞苷脱氧核糖核苷酸在其催化结构域，其中仅由13个核苷酸。这种DNAzyme催化RNA磷酸二酯键的Mn 2+依赖性切割比相应的未催化反应快约5300倍，但比亲本慢约10000倍。由二进制核苷酸字母表制成的催化DNA分子的展示拓宽了我们对核酸介导的催化作用的基本限制的理解。
Single-stranded DNA molecules have the capacity to adopt catalytically active structures known as DNAzymes, although the fundamental limits of this ability have not been determined. Starting with a parent DNAzyme composed of all four types of standard nucleotides, we conducted a search of the surrounding sequence space to identify functional derivatives with catalytic cores composed of only three, and subsequently only two types of nucleotides. We provide the first report of a DNAzyme that contains only guanosine and cytidine deoxyribonucleotides in its catalytic domain, which consists of just 13 nucleotides. This DNAzyme catalyzes the Mn2+-dependent cleavage of an RNA phosphodiester bond ∼5300-fold faster than the corresponding uncatalyzed reaction, but ∼10 000-fold slower than the parent. The demonstration of a catalytic DNA molecule made from a binary nucleotide alphabet broadens our understanding of the fundamental limits of nucleic-acid-mediated catalysis.
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影响因子：
14.9
作者：
Schlosser K;Gu J;Lam JC;Li Y
通讯作者：
Li Y
DOI：
10.1073/pnas.94.9.4262
发表时间：
1997-04-29
影响因子：
11.1
作者：
Santoro, SW;Joyce, GF
通讯作者：
Joyce, GF
DOI：
10.1007/s00018-008-8029-y
发表时间：
2008-07
期刊：
Cellular and molecular life sciences : CMLS
影响因子：
--
作者：
Baum DA;Silverman SK
通讯作者：
Silverman SK
影响因子：
4.5
作者：
Breaker, RR;Emilsson, GM;Sudarsan, N
通讯作者：
Sudarsan, N
影响因子：
15
作者：
Li, YF;Breaker, RR
通讯作者：
Breaker, RR