Introducing meta-services for biomedical information extraction.

Introducing meta-services for biomedical information extraction.
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DOI:
10.1186/gb-2008-9-s2-s6
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发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
12.3
通讯作者:
Valencia A
Valencia A
中科院分区:
生物学1区
文献类型:
--
作者:
Leitner F;Krallinger M;Rodriguez-Penagos C;Hakenberg J;Plake C;Kuo CJ;Hsu CN;Tsai RT;Hung HC;Lau WW;Johnson CA;Saetre R;Yoshida K;Chen YH;Kim S;Shin SY;Zhang BT;Baumgartner WA Jr;Hunter L;Haddow B;Matthews M;Wang X;Ruch P;Ehrler F;Ozgür A;Erkan G;Radev DR;Krauthammer M;Luong T;Hoffmann R;Sander C;Valencia A

文献摘要

参考文献

被引文献

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我们介绍了第一个元服务的信息提取在分子生物学,BioCreative MetaServer(BCMS;)。这个原型平台是13个研究小组的共同努力,并为PubMed/Medline摘要提供自动生成的注释。注释类型包括基因名称、基因ID、物种和蛋白质-蛋白质相互作用。元服务器以人类和机器可读的格式(HTML/XML)分发注释。该服务旨在供生物医学研究人员和数据库注释者以及生物医学语言处理使用。该平台允许注释的直接比较、统一访问和结果聚合。
We introduce the first meta-service for information extraction in molecular biology, the BioCreative MetaServer (BCMS; ). This prototype platform is a joint effort of 13 research groups and provides automatically generated annotations for PubMed/Medline abstracts. Annotation types cover gene names, gene IDs, species, and protein-protein interactions. The annotations are distributed by the meta-server in both human and machine readable formats (HTML/XML). This service is intended to be used by biomedical researchers and database annotators, and in biomedical language processing. The platform allows direct comparison, unified access, and result aggregation of the annotations.
DOI: 10.1186/gb-2008-9-s2-s10
发表时间: 2008
期刊: Genome biology
影响因子: 12.3
作者:
Alex B;Grover C;Haddow B;Kabadjov M;Klein E;Matthews M;Tobin R;Wang X
通讯作者: Wang X
DOI: 10.1186/1471-2105-6-s1-s23
发表时间: 2005
期刊: BMC bioinformatics
影响因子: 3
作者:
Ehrler F;Geissbühler A;Jimeno A;Ruch P
通讯作者: Ruch P
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DOI: 10.1186/gb-2008-9-s2-s1
发表时间: 2008
期刊: Genome biology
影响因子: 12.3
作者:
Krallinger M;Morgan A;Smith L;Leitner F;Tanabe L;Wilbur J;Hirschman L;Valencia A
通讯作者: Valencia A
基因提到了与上下文模型和句子图案的归一化和互动提取。
DOI: 10.1186/gb-2008-9-s2-s14
发表时间: 2008
期刊: Genome biology
影响因子: 12.3
作者:
Hakenberg J;Plake C;Royer L;Strobelt H;Leser U;Schroeder M
通讯作者: Schroeder M
IHOP Web服务。
DOI: 10.1093/nar/gkm298
发表时间: 2007-07
影响因子: 14.9
作者:
Fernandez, Jose M;Hoffmann, Robert;Valencia, Alfonso
通讯作者: Valencia, Alfonso