Transposons As Tools for Functional Genomics in Vertebrate Models.
Transposons As Tools for Functional Genomics in Vertebrate Models.
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DOI：
10.1016/j.tig.2017.07.006
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发表时间：
2017-11
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Ivics Z
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kawakami K;Largaespada DA;Ivics Z
基于转座因子的遗传工具和诱变策略目前正在开发中，其愿景是将脊椎动物模型中的主要DNA序列信息与基因功能联系起来。由于转座子具有插入DNA的固有能力，因此可以将其开发成用于染色体操作的强大工具。基于转座子的正向诱变筛选具有许多优点，包括高通量、突变等位基因的容易鉴定以及基于表型提供对遗传网络和途径的洞察。例如，睡美人转座子已经成为以组织特异性方式在实验动物中诱导肿瘤的重要工具，目的是揭示各种癌症的遗传基础。在这里，我们描述了一个电池的诱变盒，可以与转座子载体一起应用，诱变基因，并强调通用的实验策略，用于产生工程染色体的功能丧失以及获得功能的诱变功能基因注释的脊椎动物模型，包括斑马鱼，小鼠和大鼠。
Genetic tools and mutagenesis strategies based on transposable elements are currently under development with a vision to link primary DNA sequence information to gene functions in vertebrate models. By virtue of their inherent capacity to insert into DNA, transposons can be developed into powerful tools for chromosomal manipulations. Transposon-based forward mutagenesis screens have numerous advantages including high throughput, easy identification of mutated alleles and providing insight into genetic networks and pathways based on phenotypes. For example, the Sleeping Beauty transposon has become highly instrumental to induce tumors in experimental animals in a tissue-specific manner with the aim of uncovering the genetic basis of diverse cancers. Here, we describe a battery of mutagenic cassettes that can be applied in conjunction with transposon vectors to mutagenize genes, and highlight versatile experimental strategies for the generation of engineered chromosomes for loss-of-function as well as gain-of-function mutagenesis for functional gene annotation in vertebrate models, including zebrafish, mice and rats.
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影响因子：
30.8
作者：
Bard-Chapeau, Emilie A.;Nguyen, Anh-Tuan;Rust, Alistair G.;Sayadi, Ahmed;Lee, Philip;Chua, Belinda Q.;New, Lee-Sun;de Jong, Johann;Ward, Jerrold M.;Chin, Christopher K. Y.;Chew, Valerie;Han Chong Toh;Abastado, Jean-Pierre;Benoukraf, Touati;Soong, Richie;Bard, Frederic A.;Dupuy, Adam J.;Johnson, Randy L.;Radda, George K.;Chan, Eric Chun Yong;Wessels, Lodewyk F. A.;Adams, David J.;Jenkins, Nancy A.;Copeland, Neal G.
通讯作者：
Copeland, Neal G.
罗非鱼（Oreochromis niloticus）中的TOL2介导的转基因。
影响因子：
4.5
作者：
Fujimura, Koji;Kocher, Thomas D.
通讯作者：
Kocher, Thomas D.
影响因子：
4.5
作者：
de Jong J;Akhtar W;Badhai J;Rust AG;Rad R;Hilkens J;Berns A;van Lohuizen M;Wessels LF;de Ridder J
通讯作者：
de Ridder J
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2.7
作者：
Davison, Jon M.;Akitake, Courtney M.;Parsons, Michael J.
通讯作者：
Parsons, Michael J.
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56.9
作者：
COOLEY, L;KELLEY, R;SPRADLING, A
通讯作者：
SPRADLING, A