GenBank: update
GenBank: update
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DOI：
10.1093/nar/gkh045
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发表时间：
2004-01-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Wheeler, DL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Benson, DA;Karsch-Mizrachi, I;Wheeler, DL
GenBank (R) 是一个综合数据库，包含超过 140 000 种已命名生物体的公开 DNA 序列，这些序列主要通过各个实验室的提交和大规模测序项目的批量提交获得。大多数提交都是使用 Bankit（网络）或 Sequin 程序进行的，登录号由 GenBank 工作人员在收到后分配。与英国 EMBL 数据库和日本 DNA 数据库的日常数据交换有助于确保全球覆盖。 GenBank 可通过 NCBI 的检索系统 Entrez 访问，该系统集成了来自主要 DNA 和蛋白质序列数据库的数据以及分类学、基因组图谱、蛋白质结构和域信息，以及通过 PubMed 获取的生物医学期刊文献。 BLAST 提供 GenBank 和其他序列数据库的序列相似性搜索。 GenBank 数据库的完整双月发布和每日更新可通过 FTP 获取。要访问 GenBank 及其相关检索和分析服务，请访问 NCBI 主页：hftp://www.ncbi.nim.nih.gov。
GenBank (R) is a comprehensive database that contains publicly available DNA sequences for more than 140 000 named organisms, obtained primarily through submissions from individual laboratories and batch submissions from large-scale sequencing projects. Most submissions are made using the Bankit (web) or Sequin program and accession numbers are assigned by GenBank staff upon receipt. Daily data exchange with the EMBL Data Library in the UK and the DNA Data Bank of Japan helps ensure worldwide coverage. GenBank is accessible through NCBI's retrieval system, Entrez, which integrates data from the major DNA and protein sequence databases along with taxonomy, genome mapping, protein structure and domain information, and the biomedical journal literature via PubMed. BLAST provides sequence similarity searches of GenBank and other sequence databases. Complete bimonthly releases and daily updates of the GenBank database are available by FTP. To access GenBank and its related retrieval and analysis services, go to the NCBI home page at: hftp://www.ncbi.nim.nih.gov.