Analysis of human oral microbiota: an overview and its application

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人类口腔微生物群分析:概述及其应用

DOI:
10.11266/jpan.21.3_154
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发表时间:
2018
期刊:
Journal of Pet Animal Nutrition
影响因子:
--
通讯作者:
渡辺 孝康
渡辺 孝康
中科院分区:
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文献类型:
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作者:
Yamada Shunsuke;Shibasaki Masaki;Murase Kazunori;Watanabe Takayasu;Aikawa Chihiro;Nozawa Takashi;Nakagawa Ichiro;渡辺 孝康

文献摘要

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菌の種類によってこの遺伝子の塩基配列はわずかに異なっている. 高速シーケンサーを用いて, 細菌叢に存在する多種多様な細菌の 16S rRNA 遺伝子の塩基配列を一挙に取得できれば, 細菌の種類と存在割合を一度に知ることができる [2].また, 16S rRNA 遺伝子のみに絞らず, 抽出した DNA 全ての塩基配列を一挙に取得する方法もある. これをメタゲノム (metagenome) 解析といい,「高次の」「超越した」 などの意味を持つ接頭辞 meta-をゲノム (genome) に付与したもので, 多種多様な細菌のゲノムに含まれる遺伝子全てを一挙に解析することを意味している. 一般にメタゲノム解析といった場合, 前述の 16S rRNA 遺伝子解析を指すことも多いが, 厳密に区別するならばゲノムを網羅的に解析するこちらの意味であると捉えたほうがよい.