Usage of the Sea Urchin Hemicentrotus pulcherrimus Database, HpBase
Usage of the Sea Urchin Hemicentrotus pulcherrimus Database, HpBase
复制标题
海胆 Hemicentrotus pulcherrimus 数据库 (HpBase) 的使用
DOI：
10.1007/978-1-0716-0974-3_17
复制
发表时间：
2020
影响因子：
--
通讯作者：
Yaguchi Shunsuke
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kinjo Sonoko;Kiyomoto Masato;Yamamoto Takashi;Ikeo Kazuho;Yaguchi Shunsuke
HpBase（ http://cell-innovation.nig.ac.jp/Hpul/ ）是一个提供海胆Hemicentrotus pulcherrimus基因组和转录组资源的数据库。除了下载大量数据外，还提供了几种用于资源使用的分析工具：基因搜索，同源性搜索和基因组浏览。HpBase还公开了使用H. pulcherrimus已经积累到目前为止。因此，HpBase可以帮助来自各个领域的研究人员有效地利用基因组资源-进化，发育和细胞生物学。在本章中，我们将介绍HpBase中工具的概述和使用方法。
HpBase ( http://cell-innovation.nig.ac.jp/Hpul/ ) is a database that provides genome and transcriptome resources of the sea urchinHemicentrotus pulcherrimus. In addition to downloading the bulk data, several analysis tools for resource use are available: gene search, homology search, and genome browsing. HpBase also discloses the protocols for biological experiments usingH. pulcherrimusthat have been accumulated so far. Therefore, HpBase can assist efficient use of genome resources for researchers from various fields—evolutionary, developmental, and cell biology. In this chapter we present an overview and usage of tools in HpBase.