Functional genomics evidence unearths new moonlighting roles of outer ring coat nucleoporins.
Functional genomics evidence unearths new moonlighting roles of outer ring coat nucleoporins.
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DOI：
10.1038/srep04655
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发表时间：
2014-04-11
影响因子：
4.6
通讯作者：
Ouzounis CA
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Katsani KR;Irimia M;Karapiperis C;Scouras ZG;Blencowe BJ;Promponas VJ;Ouzounis CA
越来越多的证据表明，y复合体核孔蛋白（Y-Nups）参与了真核生物核孔内核以外的细胞过程。为了全面评估Y-Nups可能的功能范围，我们通过高特异性序列谱和组织特异性表达模式划分了它们的结构和功能特性。我们的分析确定了具有新型复合结构域结构的真核生物中存在Y-Nups，支持DNA修复，RNA加工，信号传导和有丝分裂控制中的新兼职功能。与已发现结构域的一个选择子集相关的Y-Nups被发现在不同的人类和小鼠细胞类型和组织中受到严格的协调调节，这强烈暗示它们与核孔一起起作用。总的来说，我们的研究结果揭示了Y-Nup相互作用的扩展网络，从而支持了y复合物作为细胞中具有多种功能角色的动态蛋白质组装的新兴观点。
There is growing evidence for the involvement of Y-complex nucleoporins (Y-Nups) in cellular processes beyond the inner core of nuclear pores of eukaryotes. To comprehensively assess the range of possible functions of Y-Nups, we delimit their structural and functional properties by high-specificity sequence profiles and tissue-specific expression patterns. Our analysis establishes the presence of Y-Nups across eukaryotes with novel composite domain architectures, supporting new moonlighting functions in DNA repair, RNA processing, signaling and mitotic control. Y-Nups associated with a select subset of the discovered domains are found to be under tight coordinated regulation across diverse human and mouse cell types and tissues, strongly implying that they function in conjunction with the nuclear pore. Collectively, our results unearth an expanded network of Y-Nup interactions, thus supporting the emerging view of the Y-complex as a dynamic protein assembly with diverse functional roles in the cell.
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DOI：
10.1073/pnas.0506345103
发表时间：
2006-02-14
影响因子：
11.1
作者：
Devos, D;Dokudovskaya, S;Sali, A
通讯作者：
Sali, A
影响因子：
64.5
作者：
Bermejo R;Capra T;Jossen R;Colosio A;Frattini C;Carotenuto W;Cocito A;Doksani Y;Klein H;Gómez-González B;Aguilera A;Katou Y;Shirahige K;Foiani M
通讯作者：
Foiani M
核孔蛋白水平调节细胞周期进程和阶段特异性基因表达。
影响因子：
11.8
作者：
Chakraborty, Papia;Wang, Yaming;Wei, Jen-Hsuan;van Deursen, Jan;Yu, Hongtao;Malureanu, Liviu;Dasso, Mary;Forbes, Douglass J.;Levy, David E.;Seemann, Joachim;Fontoura, Beatriz M. A.
通讯作者：
Fontoura, Beatriz M. A.
影响因子：
9.8
作者：
Light WH;Freaney J;Sood V;Thompson A;D'Urso A;Horvath CM;Brickner JH
通讯作者：
Brickner JH
影响因子：
3.7
作者：
Gonzalez-Aguilera, Cristina;Askjaer, Peter
通讯作者：
Askjaer, Peter