Control of foot differentiation in Hydra: Phylogenetic footprinting indicates interaction of head, bud and foot patterning systems
Control of foot differentiation in Hydra: Phylogenetic footprinting indicates interaction of head, bud and foot patterning systems
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水螅足分化的控制：系统发育足迹表明头、芽和足图案系统的相互作用
DOI：
10.1016/j.mod.2005.04.010
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发表时间：
2005
影响因子：
2.6
通讯作者：
T. Bosch
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
S. Siebert;S. Thomsen;M. M. Reimer;T. Bosch
同源结构域转录因子CnNK-2似乎在水螅足的形成中起主要作用。最近，我们报道了体外证据表明，CnNK-2具有自动调节功能，并调节形态发生肽pedibin的表达。我们提出，CnNK-2和pedibin协同协调足分化过程[Alfresen，S.，Till，A.，Wittlieb，J.，比茨，Khalturin，K.，博世，T. C.的方法，2004.水螅足分化的控制：NK-2同源框因子CnNK-2自动调节自身表达并使用pedibin作为靶基因的体外证据。机械设备121，195-204]。在这里，我们进一步分析了控制水螅足形成的调控网络。通过系统发育足迹法，我们比较了两个密切相关的物种，普通水螅和寡水螅的CnNK-2 5′-侧翼序列。出乎意料的是，我们在CnNK-2 5′-侧翼区检测到一个高度保守的HNF-3β（脊椎动物Forkhead转录因子）结合位点。水螅HNF-3β同源物芽头主要在体柱的顶端区域和出芽早期表达。Budhead不存在于表达CnNK-2的组织中，并且被认为参与决定用于头部分化的组织[Martinez，D.E.，Dirksen，M. L.，博德，P.M.，Jamrich，M.，斯蒂尔，R. E.，博德，人力资源部，1997. Budhead是一种叉头/HNF-3β同源物，在水螅的轴形成和头部规格期间表达。Dev. 192，523-536]。通过电泳迁移率变动分析，我们证明了重组芽头蛋白与CnNK-2 5′-侧翼区的种间保守HNF-3β结合基序之间的体外相互作用。我们的研究结果加强了CnNK-2作为一个重要的调节剂在足部图案化过程中的观点。此外，他们指出芽头作为CnNK-2转录调节因子的候选者，并在分子水平上指出水螅中脚和头模式化过程的相互作用。
Homeodomain transcription factor CnNK-2 seems to play a major role in foot formation in Hydra. Recently, we reported in vitro evidence indicating that CnNK-2 has autoregulatory features and regulates expression of the morphogenetic peptide pedibin. We proposed that CnNK-2 and pedibin synergistically orchestrate foot differentiation processes [Thomsen, S., Till, A., Wittlieb, J., Beetz, C., Khalturin, K., Bosch, T. C., 2004. Control of foot differentiation in Hydra: in vitro evidence that the NK-2 homeobox factor CnNK-2 autoregulates its own expression and uses pedibin as target gene. Mech. Dev. 121, 195–204]. Here, we further analyzed the regulatory network controlling foot formation in Hydra. By phylogenetic footprinting we compared the CnNK-2 5′-flanking sequence from two closely related species, Hydra vulgaris and Hydra oligactis. Unexpectedly, we detected a highly conserved binding site for HNF-3β, a vertebrate Forkhead transcription factor, in the CnNK-2 5′-flanking region. The Hydra HNF-3β homolog budhead is predominantly expressed in the apical region of the body column and early during budding. Budhead is absent from tissue expressing CnNK-2 and thought to be involved in determining tissue for head differentiation [Martinez, D.E., Dirksen, M.L., Bode, P. M., Jamrich, M., Steele, R.E., Bode, H.R., 1997. Budhead, a fork head/HNF-3β homolog, is expressed during axis formation and head specification in hydra. Dev. Biol. 192, 523–536]. By electrophoretic mobility shift assays we demonstrate an in vitro interaction between recombinant budhead protein and the interspecific conserved HNF-3β binding motif in the CnNK-2 5′-flanking region. Our results strengthen the view of CnNK-2 as an important regulator during foot patterning processes. Furtheron, they point to budhead as a candidate for a transcriptional regulator of CnNK-2 and to an interaction of foot and head patterning processes in Hydra on the molecular level.
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影响因子：
4.6
作者：
Ann Grens;E. Mason;J. Marsh;H. Bode
通讯作者：
Ann Grens;E. Mason;J. Marsh;H. Bode
水螅金属蛋白酶 2 (HMP2) 的鉴定和表征：一种类似 meprin 的虾蛋白金属蛋白酶，在足部形态发生中发挥作用。
DOI：
10.1242/dev.127.1.129
发表时间：
2000
期刊：
Development (Cambridge, England)
影响因子：
--
作者：
Yan,L;Fei,K;Zhang,J;Dexter,S;SarrasJr,MP
通讯作者：
SarrasJr,MP
新型信号肽 pedibin 和 Hym-346 降低了位置值，从而增强了水螅的足部形成。
DOI：
10.1242/dev.126.3.517
发表时间：
1999
期刊：
Development (Cambridge, England)
影响因子：
--
作者：
Grens,A;Shimizu,H;Hoffmeister,SA;Bode,HR;Fujisawa,T
通讯作者：
Fujisawa,T
Cngsc 是 goosecoid 的同源物，参与头部的图案形成，并在 Hydra 的组织区域中表达。
DOI：
10.1242/dev.126.23.5245
发表时间：
1999
期刊：
Development (Cambridge, England)
影响因子：
--
作者：
Broun,M;Sokol,S;Bode,HR
通讯作者：
Bode,HR
影响因子：
--
作者：
Sethi, Richa;Ananta, Jeyarama S.;Karmonik, Christof;Zhong, Meng;Fung, Steve H.;Liu, Xuewu;Li, King;Ferrari, Mauro;Wilson, Lon J.;Decuzzi, Paolo
通讯作者：
Decuzzi, Paolo