芸薹属物种（B. napus, B. oleracea, B. rapa） MAPK1家族的克隆、进化和表达特征
芸薹属物种（B. napus, B. oleracea, B. rapa） MAPK1家族的克隆、进化和表达特征
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DOI：
10.3864/j.issn.0578-1752.2013.16.019
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发表时间：
2013-05
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
陆俊杏;卢坤;朱斌;彭茜;陆奇丰;曲存民;殷家明;李加纳;梁颖;柴友荣
中科院分区：
文献类型：
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作者：
陆俊杏;卢坤;朱斌;彭茜;陆奇丰;曲存民;殷家明;李加纳;梁颖;柴友荣
【目的】克隆甘蓝型油菜、甘蓝和白菜MAPK1家族,分析3个物种MAPK1转录表达器官特异性。【方法】在电子克隆的基础上,利用RACE（rapid amplification of cDNA ends）技术获得3个物种MAPK1全长cDNA序列和gDNA序列。利用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）分析3个物种MAPK1家族的器官特异性表达特征。【结果】从甘蓝型油菜、甘蓝和白菜中克隆了MAPK1家族共4个成员基因BnMAPK1-1、BnMAPK1-2、BoMAPK1和BrMAPK1,它们的gDNA长度为2 512—2 525 bp,均有3个外显子和2个内含子,最长标准mRNA为1 599—1 620 bp,ORF均为1 100 bp。系统进化分析表明,甘蓝型油菜MAPK1家族来自于甘蓝和白菜MAPK1之和,其中,BnMAPK1-1对应于BoMAPK1,BnMAPK1-2则对应于BrMAPK1。qRT-PCR结果显示3个物种MAPK1在所有检测器官中均有表达,但器官特异性在种间差异显著,暗示快速进化。【结论】克隆了甘蓝型油菜、甘蓝和白菜MAPK1的全长cDNA序列和gDNA序列,支持甘蓝和白菜通过天然种间杂交形成异源四倍体物种甘蓝型油菜的假说,芸薹属MAPK1基因和蛋白在序列和结构上非常保守,但转录表达的器官特异性上进化极快,近缘种间差异显著。