When can we reconstruct the ancestral state? Beyond Brownian motion
When can we reconstruct the ancestral state? Beyond Brownian motion
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什么时候才能重建祖宗的状态？
DOI：
10.1007/s00285-023-01922-8
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发表时间：
2023
影响因子：
1.9
通讯作者：
Ho, Lam Si
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Vu, Nhat L.;Nguyen, Thanh P.;Nguyen, Binh T.;Dinh, Vu;Ho, Lam Si
重建一组物种的祖先状态有助于回答进化生物学中的许多重要问题。因此，了解我们何时能够准确地估计祖先的状态是至关重要的。以前的工作提供了一个必要和充分条件，称为大爆炸条件，存在一个精确的重建方法在离散性状进化模型和布朗运动模型。在本文中，我们将这一结果扩展到广泛的连续性状进化模型。特别是，我们考虑一个一般的设置，连续性状发展沿着树，根据随机过程，满足一定的规律性条件。我们验证了流行的连续性状进化模型，包括Ornstein-Uhlenbeck，反射布朗运动，有界布朗运动，和Cox-Ingersoll-Ross这些条件。
Reconstructing the ancestral state of a group of species helps answer many important questions in evolutionary biology. Therefore, it is crucial to understand when we can estimate the ancestral state accurately. Previous works provide a necessary and sufficient condition, called the big bang condition, for the existence of an accurate reconstruction method under discrete trait evolution models and the Brownian motion model. In this paper, we extend this result to a wide range of continuous trait evolution models. In particular, we consider a general setting where continuous traits evolve along the tree according to stochastic processes that satisfy some regularity conditions. We verify these conditions for popular continuous trait evolution models including Ornstein–Uhlenbeck, reflected Brownian Motion, bounded Brownian Motion, and Cox–Ingersoll–Ross.
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