The Membrane Protein Data Bank.
The Membrane Protein Data Bank.
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DOI：
10.1007/s00018-005-5350-6
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发表时间：
2006-01
影响因子：
8
通讯作者：
Caffrey, M
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Raman, P;Cherezov, V;Caffrey, M
膜蛋白数据库 (MPDB) 是一个在线、可搜索的关系数据库，包含有关完整、锚定和外周膜蛋白和肽的结构和功能信息。数据来源于蛋白质数据库和其他数据库以及文献。结构基于 X 射线和电子衍射、核磁共振和冷冻电子显微镜。 MPDB可通过蛋白质特征、结构测定方法、结晶技术、去污剂、温度、pH、作者等在线搜索。记录条目与PDB和Pfam超链接，用于查看序列、三维结构和域结构以及下载坐标。还提供了 PubMed 的链接。 MPDB 每周与蛋白质数据库同步更新。可以在线执行和查看 MPDB 记录的统计分析。提供了应用于 MPDB 中条目的统计数据摘要。数据表明适合新型膜蛋白结晶试验的条件。
The Membrane Protein Data Bank (MPDB) is an online, searchable, relational database of structural and functional information on integral, anchored and peripheral membrane proteins and peptides. Data originates from the Protein Data Bank and other databases, and from the literature. Structures are based on X-ray and electron diffraction, nuclear magnetic resonance and cryoelectron microscopy. The MPDB is searchable online by protein characteristic, structure determination method, crystallization technique, detergent, temperature, pH, author, etc. Record entries are hyperlinked to the PDB and Pfam for viewing sequence, three-dimensional structure and domain architecture, and for downloading coordinates. Links to PubMed are also provided. The MPDB is updated weekly in parallel with the Protein Data Bank. Statistical analysis of MPDB records can be performed and viewed online. A summary of the statistics as applied to entries in the MPDB is presented. The data suggest conditions appropriate for crystallization trials with novel membrane proteins.
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