Structure and activity of the RNA-targeting Type III-B CRISPR-Cas complex of Thermus thermophilus.
Structure and activity of the RNA-targeting Type III-B CRISPR-Cas complex of Thermus thermophilus.
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Thermus Thermophilus的III-B CRISPR-CAS复合物的结构和活性。
DOI：
10.1016/j.molcel.2013.09.013
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发表时间：
2013-10-10
期刊：
影响因子：
16
通讯作者：
Shinkai, Akeo
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Staals, Raymond H. J.;Agari, Yoshihiro;Maki-Yonekura, Saori;Zhu, Yifan;Taylor, David W.;van Duijn, Esther;Barendregt, Arjan;Vlot, Marnix;Koehorst, Jasper J.;Sakamoto, Keiko;Masuda, Akiko;Dohmae, Naoshi;Schaap, Peter J.;Doudna, Jennifer A.;Heck, Albert J. R.;Yonekura, Koji;van der Oost, John;Shinkai, Akeo
CRISPR-Cas系统是针对遗传元件的原核宿主防御系统。嗜热栖热菌的III-B型CRISPR-Cas系统，即TtCmr复合物，由六种不同的蛋白质亚基（Cmr 1 -6）和一种crRNA组成，化学计量为Cmr 112131445361：crRNA 1。TtCmr复合物与40和46 nt的crRNA种类共纯化，所述crRNA种类源自CRISPR基因座和间隔区的不同子集。TtCmr复合物通过5'标尺机制以6 nt间隔在多个位点切割靶RNA。电子显微镜显示，TtCmr的结构类似于一个“海蠕虫”，是由一个Cmr 2 -3异二聚体的“尾巴”，Cmr 4亚基的螺旋骨架Cmr 5亚基，和一个卷曲的“头”含有Cmr 1和Cmr 6。尽管具有仅四个Cmr 4亚基的主链并且更长且更窄，但TtCmr的整体结构类似于I型级联复合物的结构。
The CRISPR-Cas system is a prokaryotic host defense system against genetic elements. The Type III-B CRISPR-Cas system of the bacterium Thermus thermophilus, the TtCmr complex, is composed of six different protein subunits (Cmr1-6) and one crRNA with a stoichiometry of Cmr112131445361:crRNA1. The TtCmr complex co-purifies with crRNA species of 40 and 46 nt, originating from a distinct subset of CRISPR loci and spacers. The TtCmr complex cleaves the target RNA at multiple sites with 6 nt intervals via a 5’ ruler mechanism. Electron microscopy revealed that the structure of TtCmr resembles a ‘sea worm’ and is composed of a Cmr2-3 heterodimer ‘tail’, a helical backbone of Cmr4 subunits capped by Cmr5 subunits, and a curled ‘head’ containing Cmr1 and Cmr6. Despite having a backbone of only four Cmr4 subunits and being both longer and narrower, the overall architecture of TtCmr resembles that of Type I Cascade complexes.
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影响因子：
16
作者：
Hale, Caryn R.;Majumdar, Sonali;Elmore, Joshua;Pfister, Neil;Compton, Mark;Olson, Sara;Resch, Alissa M.;Glover, Claiborne V. C., III;Graveley, Brenton R.;Terns, Rebecca M.;Terns, Michael P.
通讯作者：
Terns, Michael P.
DOI：
10.1126/science.1165771
发表时间：
2008-12-19
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Marraffini LA;Sontheimer EJ
通讯作者：
Sontheimer EJ
影响因子：
48
作者：
Langmead, Ben;Salzberg, Steven L.
通讯作者：
Salzberg, Steven L.
影响因子：
56.9
作者：
Jinek, Martin;Chylinski, Krzysztof;Charpentier, Emmanuelle
通讯作者：
Charpentier, Emmanuelle
影响因子：
1.6
作者：
Fang, Lei;Jia, Kun-Zhi;Hua, Zi-Chun
通讯作者：
Hua, Zi-Chun