Genome-wide association study and meta-analysis find that over 40 loci affect risk of type 1 diabetes.
Genome-wide association study and meta-analysis find that over 40 loci affect risk of type 1 diabetes.
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DOI：
10.1038/ng.381
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发表时间：
2009-06
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Rich, Stephen S.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Barrett, Jeffrey C.;Clayton, David G.;Concannon, Patrick;Akolkar, Beena;Cooper, Jason D.;Erlich, Henry A.;Julier, Cecile;Morahan, Grant;Nerup, Jorn;Nierras, Concepcion;Plagnol, Vincent;Pociot, Flemming;Schuilenburg, Helen;Smyth, Deborah J.;Stevens, Helen;Todd, John A.;Walker, Neil M.;Rich, Stephen S.
1型糖尿病（T1D）是一种常见的自身免疫性疾病，由多种遗传和环境风险因素共同作用引起。我们报告了一项新的T1D全基因组关联研究的发现，并结合了先前发表的两项研究的荟萃分析。总样本集包括7514例病例和9045个参考样本。在荟萃分析中，41个不同的基因组位置提供了与T1D相关的证据（P < 10-6）。在排除先前报道的关联后，对27个地区的4,267例病例、4,463例对照和2,319个受影响的兄弟姐妹对（ASP）家庭进行了进一步测试。其中，18个区域重复（P < 0.01；总P < 5 × 10-8），另外4个区域提供了名义上的重复证据（P < 0.05）。这些结果提示了许多新的候选基因包括IL10、IL19、IL20、GLIS3、CD69和IL27。
Type 1 diabetes (T1D) is a common autoimmune disorder that arises from the action of multiple genetic and environmental risk factors. We report the findings of a new genome-wide association study of T1D, combined in a meta-analysis with two previously published studies. The total sample set included 7,514 cases and 9,045 reference samples. Forty-one distinct genomic locations provided evidence for association to T1D in the meta-analysis (P < 10-6). After excluding previously reported associations, 27 regions were further tested in an independent set of 4,267 cases, 4,463 controls and 2,319 affected sib-pair (ASP) families. Of these, 18 regions were replicated (P < 0.01; overall P < 5 × 10-8) and four additional regions provided nominal evidence of replication (P < 0.05). The many new candidate genes suggested by these results include IL10, IL19, IL20, GLIS3, CD69 and IL27.
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人类1型糖尿病易感性基因座图与染色体21q22.3。
影响因子：
7.7
作者：
Concannon P;Onengut-Gumuscu S;Todd JA;Smyth DJ;Pociot F;Bergholdt R;Akolkar B;Erlich HA;Hilner JE;Julier C;Morahan G;Nerup J;Nierras CR;Chen WM;Rich SS;Type 1 Diabetes Genetics Consortium
通讯作者：
Type 1 Diabetes Genetics Consortium
影响因子：
8.2
作者：
Bjornvold, M.;Undlien, D. E.;Joner, G.;Dahl-Jorgensen, K.;Njolstad, P. R.;Akselsen, H. E.;Gervin, K.;Ronningen, K. S.;Stene, L. C.
通讯作者：
Stene, L. C.
影响因子：
12.3
作者：
Gentleman RC;Carey VJ;Bates DM;Bolstad B;Dettling M;Dudoit S;Ellis B;Gautier L;Ge Y;Gentry J;Hornik K;Hothorn T;Huber W;Iacus S;Irizarry R;Leisch F;Li C;Maechler M;Rossini AJ;Sawitzki G;Smith C;Smyth G;Tierney L;Yang JY;Zhang J
通讯作者：
Zhang J
影响因子：
7.7
作者：
Hakonarson, Hakon;Qu, Hui-Qi;Polychronakos, Constantin
通讯作者：
Polychronakos, Constantin
影响因子：
1.8
作者：
Chapman, JM;Cooper, JD;Clayton, DG
通讯作者：
Clayton, DG