Complete mitochondrail genome of Corydoras agassizii.
Complete mitochondrail genome of Corydoras agassizii.
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Corydoras agassizii 完整线粒体基因组
DOI：
10.1080/23802359.2020.1715277
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发表时间：
2020-01-20
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Xiao T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lv L;Su H;Xu B;Liu Q;Xiao T
我们在本研究中报告了使用 Corydoras agassizii 的下一代测序产生的完整线粒体基因组。线粒体基因组总长度为16,562 bp，碱基组成为32.6% A、25.9% T、26.8% C、14.7% G等。它包含两个rRNA基因、22个tRNA基因、13个蛋白质编码基因和一个945 bp的非编码控制区（D环区）。这些基因的序列与鲶形目中发现的一致。 C. 完整的线粒体基因组采用Neighbour-Joining方法通过系统发育分析构建了agassizii和其他17种鱼类。拓扑结构表明，参与分析的物种属于 9 个属 3 个类群（鲶科、Loricariidae 和 Callichthyidae）。 agassizii 与 Corydoras 属的其他物种聚集在一起。 C．外部形态特征agassiziia与分子分类结果一致，因此今后可利用线粒体基因组对Corydoras进行物种鉴定。
We reported the complete mitochondrial genome yielded using next-generation sequencing ofCorydoras agassiziiin this study. The total length of the mitochondrial genome is 16,562 bp, with the base composition of 32.6% A, 25.9% T, 26.8% C, and 14.7% G, in several. It contains two rRNA genes, 22 tRNA genes, 13 protein-coding genes, and a 945 bp non-coding control region (D-loop region). The sequence of these genes is consistent with that found in the Siluriformes. The complete mitogenomes ofC. agassiziiand other 17 species of fish were constructed by phylogenetic analysis using Neighbour-Joining method. The topological structure indicated that species participating in the analysis belong to three groups (Siluridae, Loricariidae, and Callichthyidae) of nine genera, and theC. agassizii was clustered with other species from genusCorydoras. The external morphological characteristics ofC. agassiziiare consistent with the results of molecular classification, so the mitogenome can be used to identifyCorydorasspecies in the future.
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