人BLM基因相关LncRNAs的筛选及其在不同前列腺癌细胞中的表达分析

人BLM基因相关LncRNAs的筛选及其在不同前列腺癌细胞中的表达分析
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DOI：
10.3969/j.issn.1674-7968.2021.05.009
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发表时间：
2021
期刊：
农业生物技术学报
影响因子：
--
通讯作者：
许厚强
许厚强
中科院分区：
其他
文献类型：
--
作者：
罗斌杰;杨丽红;李永;谌颖莲;赵佳福;许厚强

文献摘要

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BLM解旋酶(bloom helicase, BLM)在DNA的复制、修复、重组以及维持端粒的稳定性等各方面都具有重要作用,当BLM解旋酶基因发生突变时,易患BLM综合征,甚至引发多种癌症。为探究BLM解旋酶基因相关长链非编码RNAs(long coding RNAs, LncRNAs)的表达规律,本研究以调控BLM基因相关的miR-27b-3p为关联点,利用自主开发程序SWChen2.3筛选与BLM基因相关LncRNAs,分析BLM相关LncRNAs在3种不同株系的前列腺癌细胞PC3、Lncap、22RV-1和正常人的前列腺基质成纤维细胞系WPMY-1中的表达情况。利用自主开发程序SWChen2.3筛选BLM基因相关的LncRNAs,对候选的LncRNAs进行克隆,并对其二级结构、ORF及其与BLM基因相关靶位点进行预测和分析。结果成功筛选NONHSAT203515.1(GenBank No.m130127_152334_00126_c100)(命名为BLNC203)和(GenBank No.lnc-ZBTB201: 1)(命名为BLNC246)作为研究对象,采用qRT-PCR的方法检测BLNC203和BLNC246在3种不同前列腺癌细胞和正常上皮细胞系中的表达情况。qRT-PCR结果显示2条LncRNAs在不同前列腺癌细胞中均有表达,且各细胞间表达差异明显,BLNC203在PC3、22RV-1中的表达量都极显著高于正常细胞(P0.05)。BLNC246在PC3、Lncap细胞中表达量都极显著低于正常细胞(P0.05)。BLNC203有3个ORF,BLNC246有1个ORF, BLNC203二级结构最小自由能为-239.10 kcal/mol,BLNC246的最小自由能为-85.30 kcal/mol。本研究结果将为进一步研究LncRNAs/BLM对前列腺癌细胞增殖的影响机制提供一定的理论依据。