Assaying the epigenome in limited numbers of cells.
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DOI：
10.1016/j.ymeth.2014.10.010
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发表时间：
2015-01-15
期刊：
影响因子：
4.8
通讯作者：
Greenleaf, William J.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Greenleaf, William J.
DNA测序吞吐量的惊人进步使全基因组分析表观遗传特征成为可能，如甲基化、核小体位置和翻译后修饰、染色质可及性和连通性以及转录因子结合。然而，对于稀有或珍贵的生物样品，许多方法的输入要求限制了它们的应用。在这篇综述中，我们讨论了染色质免疫沉淀、甲基化、DNA可及性和染色质构象的低输入全基因组分析的最新进展。
Spectacular advances in the throughput of DNA sequencing have allowed genome-wide analysis of epigenetic features such as methylation, nucleosome position and post-translational modification, chromatin accessibility and connectivity, and transcription factor binding. However, for rare or precious biological samples, input requirements of many of these methods limit their application. In this review we discuss recent advances for low-input genome-wide analysis of chromatin immunoprecipitation, methylation, DNA accessibility, and chromatin conformation.
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