基于水稻原生质体的染色质免疫共沉淀技术优化及应用
基于水稻原生质体的染色质免疫共沉淀技术优化及应用
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DOI：
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2021-1592
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
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通讯作者：
陈华民
中科院分区：
文献类型：
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作者：
石佳;朱秀梅;薛梦雨;余超;魏一鸣;杨凤环;陈华民
植物转录因子是植物体内调节基因表达的重要蛋白,参与多种生物学功能的调控。研究植物转录因子调控靶基因的常用方法为染色质免疫共沉淀法(chromatin immunoprecipitation,ChIP),但抗体特异性、遗传材料构建的耗时性等因素却大大限制了ChIP技术的应用范围和效果。本文通过对水稻原生质体瞬时转化、甲醛固定、免疫沉淀核酸的超声波破碎等条件的优化,建立了基于水稻原生质体的染色质免疫共沉淀技术体系(chromatin immunoprecipitation system based on rice protoplasts,ChIP-RP);并通过本技术体系验证了水稻转录因子OsNF-YA4蛋白对靶基因序列的富集作用。本技术体系将减少制备特异性抗体或构建稳定遗传材料的局限,有利于水稻转录因子直接调控靶基因的快速筛选和验证,推动水稻转录因子调控功能的分子机制解析。