Intron dynamics in ribosomal protein genes.
Intron dynamics in ribosomal protein genes.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0000141
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发表时间：
2007-01-03
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Kenmochi N
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yoshihama M;Nguyen HD;Kenmochi N
剪接体内含子在真核生物基因组中的作用仍然不清楚。对许多基因家族和物种中内含子存在/缺失模式的大规模分析是阐明这些内含子的作用的必要步骤。在这项分析中，我们使用最大似然法重建了来自22种真核生物的76个核糖体蛋白基因数据集中的2，961个内含子的进化，并通过最大简约法验证了结果。我们的研究结果表明，内含子的增益和损失的趋势不同物种在一个给定的王国，但似乎是一致的亚门内。数据集中的大多数亚门在大约10亿年前，即“大爆炸”辐射发生时发生了分歧。我们推测剪接体内含子可能在大爆炸辐射下许多真核生物的爆炸中发挥作用。
The role of spliceosomal introns in eukaryotic genomes remains obscure. A large scale analysis of intron presence/absence patterns in many gene families and species is a necessary step to clarify the role of these introns. In this analysis, we used a maximum likelihood method to reconstruct the evolution of 2,961 introns in a dataset of 76 ribosomal protein genes from 22 eukaryotes and validated the results by a maximum parsimony method. Our results show that the trends of intron gain and loss differed across species in a given kingdom but appeared to be consistent within subphyla. Most subphyla in the dataset diverged around 1 billion years ago, when the “Big Bang” radiation occurred. We speculate that spliceosomal introns may play a role in the explosion of many eukaryotes at the Big Bang radiation.
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影响因子：
3.4
作者：
Russell AG;Shutt TE;Watkins RF;Gray MW
通讯作者：
Gray MW
影响因子：
4.3
作者：
Nguyen, Hung D.;Yoshihama, Maki;Kenmochi, Naoya
通讯作者：
Kenmochi, Naoya
DOI：
10.1073/pnas.042700299
发表时间：
2002-03-19
影响因子：
11.1
作者：
Nixon, JEJ;Wang, A;Samuelson, J
通讯作者：
Samuelson, J
影响因子：
4
作者：
Philippe, H;Germot, A;Moreira, D
通讯作者：
Moreira, D
影响因子：
4.5
作者：
Yoshihama, Maki;Nakao, Akihiro;Nguyen, Hung D.;Kenmochi, Naoya
通讯作者：
Kenmochi, Naoya