中国蜘蛛抱蛋属植物 DNA 条形码研究

中国蜘蛛抱蛋属植物 DNA 条形码研究
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DOI:
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发表时间:
2018
期刊:
植物科学学报
影响因子:
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通讯作者:
何顺志
何顺志
中科院分区:
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文献类型:
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作者:
吕定豪;刘安莉;徐文芬;何顺志

文献摘要

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利用植物 DNA 条形码候选序列 matK、psbA-trnH、psbK-psbI 和 rbcL 对蜘蛛抱蛋属(Aspidistra)植物的 19 种 104 批样品进行扩增和测序,并采用相似性搜索算法(BLAST)对各序列的鉴定效率进行评价,得出蜘蛛抱蛋属物种鉴定的最佳序列。结果显示,psbK-psbI 的物种鉴定成功率为 88.7%,在单一序列中成功率最高。通过多序列组合鉴定效率的比较,发现组合序列的鉴定成功率明显高于单一序列,其中 matK+(psbK-psbI)组合的鉴定成功率高达 100%,基于该序列组合构建蜘蛛抱蛋属植物的系统发育树,结果显示同一物种的样品聚集度较好,多表现为单系。研究结果表明 matK+(psbK-psbI)序列组合可作为蜘蛛抱蛋植物种鉴定的最佳条形码序列。