Synthesis and stereospecificity of 4,5-disubstituted oxazolidinone ligands binding to T-box riboswitch RNA.
Synthesis and stereospecificity of 4,5-disubstituted oxazolidinone ligands binding to T-box riboswitch RNA.
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DOI：
10.1021/jm2006904
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发表时间：
2011-10-13
影响因子：
7.3
通讯作者：
Hines, Jennifer V.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Orac, Crina M.;Zhou, Shu;Means, John A.;Boehm, David;Bergmeier, Stephen C.;Hines, Jennifer V.
合成了两种先前研究的4,5-二取代恶唑烷酮的对映体和顺式异构体，并详细研究了它们与T-box核糖开关抗毒素模型RNA的结合。配体亲和力的表征和结合位点的定位表明，对单独结合的抗体RNA几乎没有立体特异性的区分。对映异构体之间的这种结合相似性可能是由于表面结合，它容纳了配体构象，导致可比较的配体-抗络合物接触。这些结果对于T-box抗体终止体靶向药物的发现具有重要意义，并且通常对于靶向其他不存在深度结合袋的医学相关RNA具有重要意义。
The enantiomers and the cis isomers of two previously studied 4,5-disubstituted oxazolidinones have been synthesized and their binding to the T-box riboswitch antiterminator model RNA investigated in detail. Characterization of ligand affinities and binding site localization indicate that there is little stereospecific discrimination for binding antiterminator RNA alone. This binding similarity between enantiomers is likely due to surface binding, which accommodates ligand conformations that result in comparable ligand-antiterminator contacts. These results have significant implications for T-box antiterminator-targeted drug discovery and, in general, for targeting other medicinally relevant RNA that do not present deep binding pockets.
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