A radiogenomic dataset of non-small cell lung cancer.
A radiogenomic dataset of non-small cell lung cancer.
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DOI：
10.1038/sdata.2018.202
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发表时间：
2018-10-16
期刊：
影响因子：
9.8
通讯作者：
Napel S
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bakr S;Gevaert O;Echegaray S;Ayers K;Zhou M;Shafiq M;Zheng H;Benson JA;Zhang W;Leung ANC;Kadoch M;Hoang CD;Shrager J;Quon A;Rubin DL;Plevritis SK;Napel S
癌症的医学影像生物标志物有望通过精准医学的进步改善患者护理。与基因组生物标志物相比，影像生物标志物具有无创的优势，并且能够对异质性肿瘤进行整体表征，而不像活检只能获取有限的组织。我们从一个包含211名受试者的非小细胞肺癌（NSCLC）队列中开发了一个独特的放射基因组数据集。该数据集包括计算机断层扫描（CT）、正电子发射断层扫描（PET）/CT图像、使用受控词汇对医学图像上观察到的肿瘤进行的语义标注，以及CT扫描中肿瘤的分割图。影像数据还与手术切除的肿瘤组织样本的基因突变分析结果、基因表达微阵列和RNA测序数据以及包括生存结果在内的临床数据相匹配。创建这个数据集是为了促进发现肿瘤分子特征和医学影像特征之间的潜在关系，以及开发和评估预后性医学影像生物标志物。
Medical image biomarkers of cancer promise improvements in patient care through advances in precision medicine. Compared to genomic biomarkers, image biomarkers provide the advantages of being non-invasive, and characterizing a heterogeneous tumor in its entirety, as opposed to limited tissue available via biopsy. We developed a unique radiogenomic dataset from a Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC) cohort of 211 subjects. The dataset comprises Computed Tomography (CT), Positron Emission Tomography (PET)/CT images, semantic annotations of the tumors as observed on the medical images using a controlled vocabulary, and segmentation maps of tumors in the CT scans. Imaging data are also paired with results of gene mutation analyses, gene expression microarrays and RNA sequencing data from samples of surgically excised tumor tissue, and clinical data, including survival outcomes. This dataset was created to facilitate the discovery of the underlying relationship between tumor molecular and medical image features, as well as the development and evaluation of prognostic medical image biomarkers.
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影响因子：
5
作者：
Balagurunathan, Yoganand;Gu, Yuhua;Gillies, Robert J.
通讯作者：
Gillies, Robert J.
影响因子：
2.6
作者：
Ganeshan, B.;Skogen, K.;Miles, K.
通讯作者：
Miles, K.
影响因子：
4.4
作者：
Clark, Kenneth;Vendt, Bruce;Prior, Fred
通讯作者：
Prior, Fred
影响因子：
17.1
作者：
Itakura H;Achrol AS;Mitchell LA;Loya JJ;Liu T;Westbroek EM;Feroze AH;Rodriguez S;Echegaray S;Azad TD;Yeom KW;Napel S;Rubin DL;Chang SD;Harsh GR 4th;Gevaert O
通讯作者：
Gevaert O
DOI：
10.1038/nrclinonc.2012.196
发表时间：
2013-01
期刊：
Nature reviews. Clinical oncology
影响因子：
--
作者：
Lambin P;van Stiphout RG;Starmans MH;Rios-Velazquez E;Nalbantov G;Aerts HJ;Roelofs E;van Elmpt W;Boutros PC;Granone P;Valentini V;Begg AC;De Ruysscher D;Dekker A
通讯作者：
Dekker A