An evolutionarily conserved long noncoding RNA TUNA controls pluripotency and neural lineage commitment.
An evolutionarily conserved long noncoding RNA TUNA controls pluripotency and neural lineage commitment.
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DOI：
10.1016/j.molcel.2014.01.021
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发表时间：
2014-03-20
期刊：
影响因子：
16
通讯作者：
Rana, Tariq M.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Lin, Nianwei;Chang, Kung-Yen;Li, Zhonghan;Gates, Keith;Rana, Zacharia A.;Dang, Jason;Zhang, Danhua;Han, Tianxu;Yang, Chao-Shun;Cunningham, Thomas J.;Head, Steven R.;Duester, Gregg;Dong, P. Duc Si;Rana, Tariq M.
在这里，我们生成了第一个针对小鼠 lincRNA 的基因组规模 shRNA 文库。我们对小鼠胚胎干细胞 (mESC) 进行了一项公正的功能丧失研究，并鉴定了 20 种参与维持多能性的新型 lincRNA。其中，TUNA（Tcl1 上游神经元相关 lincRNA）是多能性所必需的，并与三种 RNA 结合蛋白 (RBP) 形成复合物。在 Nanog、Sox2 和 Fgf4 的启动子处检测到 TUNA-RBP 复合物，敲低 TUNA 或单个 RBP 会抑制 mESC 的神经分化。 TUNA 在脊椎动物中显示出序列和中枢神经系统限制性表达的惊人进化保守性。因此，斑马鱼中金枪鱼的敲除会导致运动功能受损，而亨廷顿舞蹈症患者大脑中金枪鱼的表达与疾病分级显着相关。我们的结果表明，lincRNA TUNA 在 ESC 的多能性和神经分化中发挥着至关重要的作用，并且与成年脊椎动物的神经功能相关。
Here, we generated the first genome-scale shRNA library targeting lincRNAs in the mouse. We performed an unbiased loss-of-function study in mouse embryonic stem cells (mESCs) and identified 20 novel lincRNAs involved in the maintenance of pluripotency. Among these, TUNA (Tcl1 Upstream Neuron-Associated lincRNA), was required for pluripotency and formed a complex with three RNA-binding proteins (RBPs). The TUNA–RBP complex was detected at the promoters of Nanog, Sox2, and Fgf4, and knockdown of TUNA or the individual RBPs inhibited neural differentiation of mESCs. TUNA showed striking evolutionary conservation of both sequence and central nervous system-restricted expression in vertebrates. Accordingly, knockdown of tuna in zebrafish caused impaired locomotor function, and TUNA expression in the brains of Huntington’s patients was significantly associated with disease grade. Our results suggest that the lincRNA TUNA plays a vital role in pluripotency and neural differentiation of ESCs and is associated with neurological function of adult vertebrates.
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影响因子：
64.5
作者：
Huarte M;Guttman M;Feldser D;Garber M;Koziol MJ;Kenzelmann-Broz D;Khalil AM;Zuk O;Amit I;Rabani M;Attardi LD;Regev A;Lander ES;Jacks T;Rinn JL
通讯作者：
Rinn JL
影响因子：
4.8
作者：
Dempsey, LA;Sun, H;Maizels, N
通讯作者：
Maizels, N
影响因子：
64.5
作者：
Takahashi, Kazutoshi;Yamanaka, Shinya
通讯作者：
Yamanaka, Shinya
影响因子：
64.5
作者：
Rinn, John L.;Kertesz, Michael;Chang, Howard Y.
通讯作者：
Chang, Howard Y.
DOI：
10.1126/science.1192002
发表时间：
2010-08-06
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Tsai MC;Manor O;Wan Y;Mosammaparast N;Wang JK;Lan F;Shi Y;Segal E;Chang HY
通讯作者：
Chang HY