Nexplorer: phylogeny-based exploration of sequence family data
Nexplorer: phylogeny-based exploration of sequence family data
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DOI：
10.1093/bioinformatics/bti747
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发表时间：
2006-01-01
期刊：
影响因子：
5.8
通讯作者：
Stoltzfus, A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Gopalan, V;Qiu, WG;Stoltzfus, A
NExplrer是一个基于网络的程序，用于以Nexus格式交互浏览和操作字符数据，非常适合与代表同源基因或蛋白质家族的比对和树一起使用。用户可以上传序列家族数据集，或从数千个已有的数据集中进行选择。NExplorer提供了一种灵活的方法来开发将树和数据矩阵或对齐结合在一起的定制视图，创建数据子集，以及输出数据文件或出版物质量的图形。
Nexplorer is a web-based program for interactive browsing and manipulation of character data in NEXUS format, well suited for use with alignments and trees representing families of homologous genes or proteins. Users may upload a sequence family dataset, or choose from one of several thousand already available. Nexplorer provides a flexible means to develop customized views that combine a tree and a data matrix or alignment, to create subsets of data, and to output data files or publication-quality graphics.