Array programming with NumPy.
Array programming with NumPy.
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DOI：
10.1038/s41586-020-2649-2
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发表时间：
2020-09
期刊：
影响因子：
64.8
通讯作者：
Oliphant TE
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Harris CR;Millman KJ;van der Walt SJ;Gommers R;Virtanen P;Cournapeau D;Wieser E;Taylor J;Berg S;Smith NJ;Kern R;Picus M;Hoyer S;van Kerkwijk MH;Brett M;Haldane A;Del Río JF;Wiebe M;Peterson P;Gérard-Marchant P;Sheppard K;Reddy T;Weckesser W;Abbasi H;Gohlke C;Oliphant TE
数组编程提供了一个强大的，紧凑的和富有表现力的语法，用于访问，操作和操作向量，矩阵和高维数组中的数据。NumPy是Python语言的主要数组编程库。它在物理学，化学，天文学，地球科学，生物学，心理学，材料科学，工程，金融和经济学等领域的研究分析管道中发挥着重要作用。例如，在天文学中，NumPy是用于发现引力波和首次成像黑洞的软件堆栈的重要组成部分。在这里，我们将回顾一些基本的数组概念如何导致一个简单而强大的编程范式，用于组织，探索和分析科学数据。NumPy是构建科学Python生态系统的基础。它是如此普遍，以至于有几个项目针对有特殊需求的受众，开发了自己的类似NumPy的接口和数组对象。由于其在生态系统中的中心地位，NumPy越来越多地充当此类数组计算库之间的互操作性层，并与其应用程序编程接口（API）一起提供灵活的框架，以支持未来十年的科学和工业分析。NumPy是Python的主要数组编程库;在这里，我们回顾了它的基本概念，并讨论了它如何演变成越来越专业的计算库之间灵活的互操作层。
Array programming provides a powerful, compact and expressive syntax for accessing, manipulating and operating on data in vectors, matrices and higher-dimensional arrays. NumPy is the primary array programming library for the Python language. It has an essential role in research analysis pipelines in fields as diverse as physics, chemistry, astronomy, geoscience, biology, psychology, materials science, engineering, finance and economics. For example, in astronomy, NumPy was an important part of the software stack used in the discovery of gravitational waves and in the first imaging of a black hole. Here we review how a few fundamental array concepts lead to a simple and powerful programming paradigm for organizing, exploring and analysing scientific data. NumPy is the foundation upon which the scientific Python ecosystem is constructed. It is so pervasive that several projects, targeting audiences with specialized needs, have developed their own NumPy-like interfaces and array objects. Owing to its central position in the ecosystem, NumPy increasingly acts as an interoperability layer between such array computation libraries and, together with its application programming interface (API), provides a flexible framework to support the next decade of scientific and industrial analysis. NumPy is the primary array programming library for Python; here its fundamental concepts are reviewed and its evolution into a flexible interoperability layer between increasingly specialized computational libraries is discussed.
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Biopython：用于计算分子生物学和生物信息学的免费 Python 工具。
DOI：
10.1093/bioinformatics/btp163
发表时间：
2009-06-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Cock PJ;Antao T;Chang JT;Chapman BA;Cox CJ;Dalke A;Friedberg I;Hamelryck T;Kauff F;Wilczynski B;de Hoon MJ
通讯作者：
de Hoon MJ
影响因子：
0.7
作者：
Dongarra, Jack;Golub, Gene H.;Moore, Keith
通讯作者：
Moore, Keith
影响因子：
8.6
作者：
Abbott, B. P.;Abbott, R.;Zweizig, J.
通讯作者：
Zweizig, J.
影响因子：
4.4
作者：
Cheng T;Kerr T;Small W;Dong H;Montaner J;Wood E;DeBeck K
通讯作者：
DeBeck K
影响因子：
4.9
作者：
Chael, Andrew A.;Johnson, Michael D.;Bouman, Katherine L.
通讯作者：
Bouman, Katherine L.