Efficient base editing in methylated regions with a human APOBEC3A-Cas9 fusion
Efficient base editing in methylated regions with a human APOBEC3A-Cas9 fusion
复制标题
利用人类 APOBEC3A-Cas9 融合蛋白对甲基化区域进行高效碱基编辑
DOI：
10.1038/nbt.4198
复制
发表时间：
2018-10-01
影响因子：
46.9
通讯作者：
Yang, Li
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wang, Xiao;Li, Jianan;Yang, Li
碱基编辑(BES)能够产生有针对性的单核苷酸突变，但目前使用的基于大鼠APOBEC1的BES在编辑高度甲基化区域或GPC环境中的胞嘧啶时效率相对较低。通过筛选各种APOBEC和AID脱氨酶，我们表明，人类APOBEC3A结合的BES和我们设计的编辑窗口较窄的版本可以在甲基化水平和GPC二核苷酸含量较高的区域介导有效的C-T碱基编辑。
Base editors (BEs) enable the generation of targeted single-nucleotide mutations, but currently used rat APOBEC1-based BEs are relatively inefficient in editing cytosines in highly methylated regions or in GpC contexts. By screening a variety of APOBEC and AID deaminases, we show that human APOBEC3A-conjugated BEs and versions we engineered to have narrower editing windows can mediate efficient C-to-T base editing in regions with high methylation levels and GpC dinucleotide content.