Automated assembly of a reference taxonomy for phylogenetic data synthesis
Automated assembly of a reference taxonomy for phylogenetic data synthesis
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自动组装用于系统发育数据合成的参考分类法
DOI：
10.1101/116418
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发表时间：
2017
影响因子：
1.3
通讯作者：
K. Cranston
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Jonathan A. Rees;K. Cranston
分类学和命名法数据对于任何综合生物多样性数据的项目都是至关重要的，因为大多数生物多样性数据集使用分类学名称来识别分类群。Open Tree of Life就是这样一个项目，它将已发表的系统发育树综合成综合的超级树。没有一种出版的分类法能满足该项目的分类学和命名学需求。在此，我们描述了一个可重复地将多个来源分类组合成一个综合分类的系统，并讨论了下游生物多样性项目中分类和命名综合的挑战。
Taxonomy and nomenclature data are critical for any project that synthesizes biodiversity data, as most biodiversity data sets use taxonomic names to identify taxa. Open Tree of Life is one such project, synthesizing sets of published phylogenetic trees into comprehensive supertrees. No single published taxonomy met the taxonomic and nomenclatural needs of the project. Here we describe a system for reproducibly combining several source taxonomies into a synthetic taxonomy, and we discuss the challenges of taxonomic and nomenclatural synthesis for downstream biodiversity projects.
DOI：
10.1073/pnas.1423041112
发表时间：
2015-10-13
影响因子：
11.1
作者：
Hinchliff, Cody E.;Smith, Stephen A.;Cranston, Karen A.
通讯作者：
Cranston, Karen A.