Structural and functional characterization of CalS11, a TDP-rhamnose 3'-O-methyltransferase involved in calicheamicin biosynthesis.
Structural and functional characterization of CalS11, a TDP-rhamnose 3'-O-methyltransferase involved in calicheamicin biosynthesis.
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DOI：
10.1021/cb400068k
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发表时间：
2013-07-19
影响因子：
4
通讯作者：
Thorson JS
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Singh S;Chang A;Helmich KE;Bingman CA;Wrobel RL;Beebe ET;Makino S;Aceti DJ;Dyer K;Hura GL;Sunkara M;Morris AJ;Phillips GN Jr;Thorson JS
糖甲基转移酶（MT）是一类重要的剪裁酶，其催化甲基从S-腺苷-L-甲硫氨酸转移到糖基N-、C-和O-亲核试剂。虽然已经发现参与天然产物生物合成的糖N-和C-MT在随后的糖基转移酶反应之前作用于糖核苷酸底物，但迄今为止研究的相应糖O-甲基化反应发生在糖基转移反应之后。本文首次报道了利用1H-13 C-gHSQC和同位素标记底物对棘孢小单孢菌TDP-3′-O-鼠李糖甲基转移酶CalS 11进行体外表征，并在1.55 nm分辨率下进行了X射线结构测定。这项研究突出了一个独特的NMR为基础的甲基转移酶测定，暗示CalS 11是一种金属和一般的酸/碱依赖性O-甲基转移酶，并作为第一个晶体结构的TDP-己糖-O-甲基转移酶，提出了一个新的模板的机制研究和/或工程。
Sugar methyltransferases (MTs) are an important class of tailoring enzymes which catalyze the transfer of a methyl group from S-adenosyl-L-methionine to sugar-based N-, C- and O- nucleophiles. While sugar N- and C-MTs involved in natural product biosynthesis have been found to act on sugar nucleotide substrates prior to a subsequent glycosyltransferase reaction, corresponding sugar O-methylation reactions studied thus far occur after the glycosyltransfer reaction. Herein we report the first in vitro characterization using 1H-13C-gHSQC with isotopically-labeled substrates and the X-ray structure determination at 1.55 Å resolution of the TDP-3′-O-rhamnose-methyltransferase CalS11 from Micromonospora echinospora. This study highlights a unique NMR-based methyltransferase assay, implicates CalS11 to be a metal and general acid/base-dependent O-methyltransferase and, as a first crystal structure for a TDP-hexose-O-methyltransferase, presents a new template for mechanistic studies and/or engineering.
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影响因子：
2.9
作者：
Burgie, E. Sethe;Holden, Hazel M.
通讯作者：
Holden, Hazel M.
DOI：
10.1007/978-1-60327-331-2_12
发表时间：
2010-01-01
期刊：
CELL-FREE PROTEIN PRODUCTION: METHODS AND PROTOCOLS
影响因子：
--
作者：
Makino, Shin-ichi;Goren, Michael A.;Markley, John L.
通讯作者：
Markley, John L.
DOI：
10.1007/978-1-59745-196-3_4
发表时间：
2009
期刊：
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
影响因子：
--
作者：
Blommel PG;Martin PA;Seder KD;Wrobel RL;Fox BG
通讯作者：
Fox BG
DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
影响因子：
2.8
作者：
Ramos, Angelina;Lombo, Felipe;Salas, Jose A.
通讯作者：
Salas, Jose A.